Mower County er et fylke i den amerikanske delstaten Minnesota. Det ligger i den sørøstlige delen av staten og grenser mot Dodge County i nord, Olmsted County i nordøst, Fillmore County i øst og mot Freeborn County i vest. Det har også grense mot delstaten Iowa i sør.
Mower totale areal er 1 843 km² hvorav 1 km² er vann. I 2000 hadde fylket 38 603 innbyggere og administrasjonssenteret ligger i byen Austin som også er fylkets største by.
Fylket har fått sitt navn etter politikeren John Edward Mower.