Byen ble grunnlagt i 1517 som Franciscopolis etter Frans I av Frankrike, og senere fikk den navnet Le Havre-de-Grâce. Le Havre betyr havnen. Etter invasjonen av Normandie i 1944 ble byen massivt bombet. 5 000 ble drept og 12 000 hjem ble helt ødelagt.
Restaureringen 1945-1964
Etter krigen begynte arbeidet med å gjenoppbygge byen. Arbeidet med bykjernen og dens funksjoner for handel, kultur og administrasjon ble gjennomført etter en plan utarbeidet fra 1944 av et team med den modernistiske arkitekten Auguste Perret (1874–1954) som leder.
Arbeidet regnes som enestående fordi det er helhetlig tenkt og gjennomført, etter en plan som både gjenspeiler de historiske sporene etter den gamle byen, og tar i bruk nye ideer om byplanlegging og byggeteknikk. Man tok i bruk prefabrikkerte elementer, faste modulstørrelser (en modulenhet utgjorde 6,24 m) og en målrettet bruk av betongkonstruksjoner.
Saint-Joseph-kirken ble innviet i 1964, og avrundet restaureringsperioden.