Pentikäinen har utgitt flere religionshistoriske og folkloristiske arbeider hvor han bl.a. har behandlet synet på døden og ulike tema knyttet til sjamanismen.
Han er nok mest kjent for sin bok Kalevala Mythology, som gir en grundig gjennomgang av Elias Lönnrots epos, Kalevala. Her analyserer han både Lönnrots bakgrunn og eposet, og forskjellene mellom de to versjonene Lönnrot skrev. Han ser på eposet som et svar på den nasjonalromantiske stemningen som rådet i det finske samfunnet, og nettopp dette gjør eposet så betydningsfullt innenfor finsk kultur.[1][død lenke]
Trivia
Juha Pentikäinens onkel, Vilho Pentikäinen, var en berømt kommunistisk hemmelig agent som spionerte mot finske interesser for Sovjetunionen.
Bibliografi
The Nordic dead-child tradition (1968)
Marina Takalon uskonto (1971)
Kalevala Mythology (1989)
Uralic Mythology and Folklore (1989)
Suomalaisen lähtö (1990)
Northern Religions and Shamanism (1992)
Shamanism and Culture (1997)
Samaanit: pohjoisten kansojen elämäntaistelu (1998)
Shamanhood: Symbolism and Epic (Budapest: 2000).
Pyhän merkkejä kivessä (2003)
Shamanhood – The Endangered Language of the Secret Knowing (Oslo: 2003)