Ivo Scapolo ble ordinert til prest den 4. juni 1978. I 1984 gikk han inn i Den hellige stols diplomatiske tjeneste og virket først i flere nuntiaturer før han kom til seksjonen for relasjonene til statene i Statssekretariatet.
Den 17. januar 2008 ble han utnevnt til apostolisk nuntius i Rwanda.
Nuntius til Chile
Pave Benedikt XVI utnevnte ham til apostolisk nuntius i Chile den 15. juli 2011.
Scapolo spilte ingen stor rolle i å løse den misbrukskrisen som førte til Vatikanets intense gransking av Chile og førtidlig fratreden av flere biskoper.[1] Flere ofre for geistlige seksuelle overgrep hevdet at han lenge hadde bidratt i å forhindre at deres påstander ble hørt. En av dem, Juan Carlos Cruz, klaget over at Scapolo aldri møtte ofre for overgrep og beskrev ham som «en blind kar, som ikke hører ofrene eller har interesse for dem».[2]
Scapolo forsvarte sin rolle i 2015-utnevnelsen av Juan Barros Madrid til biskop av Osorno, og sa at ingen informasjon hadde blitt holdt tilbake fra Vatikanets myndigheter.[3][4] Ikke desto mindre sa fafrt Sergio Perez de Arce, som pave Frans utnevnte til apostolisk administrator av San Bartolome de Chillán som en del av hans reform av det chilenske hierarkiet, at Scapolo «ikke har vært og vil ikke være personen med den følsomhet og ferdigheter som trengs for å støtte en kirke i krise som den chilenske.»[5]
Da Chile innsatte sin nye president i mars 2018, var Den hellige stol representert av både Scapolo og av Nicola Girasoli, den apostoliske nuntius til Peru, som kirkeobservatører ifølge avisen La Tercera leste som et tegn på at Scapolo var i unåde i Vatikanet.[6]
Han fikk kritikk i Chile for sin kobling til kontroversielle biskoputnevnelser, som utnevnelsen av Barros Madrid, som ble kritisert for sin tilknytning til fader Fernando Karadima, som var blitt anklaget av flere personer for seksuelle overgrep.
Nuntius til Portugal
Den 29. august 2019 utnevnte pave Frans ham til apostolisk nuntius i Portugal.[7].