Han tok eksamen på Norges tekniske høgskole (NTH, senere NTNU), Elektroteknisk avdeling, linjen for sterkstrømteknikk i 1959. I 1963 tok han doktorgraden ved samme sted. Han var overingeniør ved Norges Vassdrags- og elektrisitetsvesen i perioden 1963-73, dosent i Vekselstrømteknikk ved NTH fra 1971 til -72 og professor samme sted fra 1973 til 2005 (Elektrisk kraftteknikk med fagområde Elektriske anlegg).
Faanes har vært vitenskapelig rådgiver ved SINTEF Energiforskning, og han har vært medlem i en lang rekke styrer og råd i virksomheter med tilknytning til energibransjen, bl.a. styrene i Statnett, Elektrisitetsforsyningens forskningsinstitutt EFI (nå SINTEF Energiforskning AS) og SINTEF.
Hans Haakon Faanes er sønn av Haakon Faanes, professor i vekselstrømteknikk ved NTH.
Verv
President i Norsk Elektroteknisk Forening, 1973-75
Medlem av styret for Elektrisitetsforsyningens forskningsinstitutt (EFI), 1973-78 og 1986-91
