Falloppio studerte for Andreas Vesalius i Padova og var senere virksom som lærer i Ferrara og Pisa. Han trådte etterhvert inn det katolske kleresi.
Som første vitenskapelig sikre beskrivelse av syfilis regnes hans bok De morbo Gallico («Om den franske sykdom»).[trenger referanse] Han anbefalte medikamenter og linsekker dyppet i anorganiske sekker mot denne plagen - som muligens var en import fra det nylig oppdagede amerikanske kontinent.[trenger referanse]
Verker
Observationes anatomicae. Venedig 1561.
De morbo Gallico. Venedig 1564.
Kunstbuch Des hocherfarnen und weytberhümpten Herrn Gabrielis Fallopij, der Artzney Doctorn von mancherley nutzlichen Künsten . Sampt einem andern büchlin / durch Christophorum Landrinum außgangen. Augspurg 1578 Digitalisert utgave - Universitäts- und Landesbibliothek Düsseldorf