Han har skrevet bestillingsverk til bl.a. Festspillene i Nord-Norge (2000) og Telemarkfestivalen (Sørsamar rundt Hardangervidda med bl.a. Transjoik, 2003), Vinterfestuka i Narvik (Àhkunjárga eller Tøtta sitt ness, 2006) og Osafestivalen (Biejjien vuelie - Solkvad, 2011)
Siden 1997 har han også komponert musikk for dokumentarer og serier på NRK og en rekke kortfilmer.
På 1990-tallet ledet han sitt «Jazz Joik Ensemble» til plateutgivelser; bandet er i dag kjent under navnet Transjoik som har fire plateutgivelser.[5] Fjellheim var også med i «Tango Concertino».