Han deltok ved konklavet 1799-1800 som valgte kardinal Chiaramonti til pave Pius VII. Hans finansielle assistanse var avgjørende for konklavet ettersom han blant annet dekket reiseutgiftene til flere fattige kardinaler.
Han fratrådte som erkebiskop av Toledo i desember 1800 for å kunne være hos pave Pius VII som en anv hans nærmeste medarbeidere.
Han ble begravet i 1804 i Roma, men i 1956 ble hans levninger flyttet til katedralen i Mexico by.