Chaudhry og hans familie flyttet til Oslo fra storbyen Lahore i Pakistan desember 1975.[2] Foreldrene ønsket at Chaudhry og hans søsken skulle få god utdanning, og farens ønsket spesielt at Chaudhry ble øyelege grunnet forhold i Pakistan.[2] Chaudhrys interesse for vitenskapelig forskning ble vekket av biografiene til blant annet Louis Pasteur og Thomas Edison.[2]
Chaudhry har karrierestipend fra Norges forskningsråd (2001–2006). Chaudhry forsker på signaloverføringer i nervekoblinger (synapser) og fikk i 2002 dr.med. fra Anatomisk institutt (UiO) for avhandlingen Amino acid transporters at the synapse som omhandler transportproteiner i sentralnervesystemet. Tidligere tilbrakte han tre år ved University of California San Francisco med den anerkjente professor Robert H. Edwards, der han begynte arbeidet med å identifisere og karakterisere flere medlemmer av en familie av nye aminosyretransportører. Disse proteinene var nøkkelen til å forstå hvordan glutamin transporteres til nerveceller, og dermed er Chaudhry også opphavsmannen til et nytt forskningsfelt.[2]
Chaudhry har publisert vitenskapelige artikler i en rekke internasjonalt anerkjente journaler, deriblant Neuron, Cell og Science. I 2006 ble han utnevnt til professor.[3]
^abcdef«Hjerneforsker med hjerte av gull». www.apollon.uio.no (på norsk). Apollon. Besøkt 6. oktober 2021. «Han var ikke mer enn fem år, da faren fortalte om planen: Farrukh, du skal bli øyelege. I Pakistan er mange rammet av øyesykdommer, og vi skal åpne øyeklinikk. (---) Farrukh Chaudhry fikk sin egen forskergruppe ved Bioteknologisenteret i Forskningsparken ved Universitetet i Oslo. Nå er han gruppeleder på Institutt for medisinske basalfag. (---) I 2002 mottok Farrukh Chaudhry H.M. Kongens gullmedalje for beste doktorgradsarbeid. Med gullmedaljen fulgte audiens på Slottet.»
^«Tidligere vinnere av Anders Jahres medisinske priser - Universitetet i Oslo». www.uio.no (på norsk). Universitetet i Oslo. Besøkt 6. oktober 2021. «Pris for yngre forskere 2006: Professor Farrukh A Chaudhry, Institutt for medisinske basalfag, Det medisinske fakultet, Universitetet i Oslo - for og ha bidratt sterkt til identifikasjonen av flere transportproteiner for glutamat og glutamin. | Professor Poul Nissen, Molekylærbiologisk Institut, Aarhus Universitet, Danmark - for sitt arbeid med kartleggingen av strukturen av viktige celleproteiner knyttet til proteinsyntese og membrantransport.»