Eindhoven er en by og kommune i provinsen Noord-Brabant sør i Nederland og lå opprinnelig der elvene Dommel og Gender renner sammen. Gender ble demt opp i etterkrigsårene, mens Dommel fremdeles renner gjennom byen.
Eindhoven ble først nevnt i skriftlige kilder i 1232, da hertug Hendrik I av Brabant ga Endehoven byrettigheter, dengang en liten by med om lag 170 hus innenfor festningsvoller. Like utenfor bymurene sto en liten borg. Byen fikk også rettigheter til å organisere et ukentlig marked og bøndene i de nærliggende landsbyene fikk komme til Eindhoven for å selge produktene sine. Eindhoven lå også langs handelsruten mellom Holland og Liège.
Rundt 1388 ble festningsverkene forsterket, og mellom 1413 og 1420 ble en ny borg bygd innenfor bymurene. I 1486 ble Eindhoven plyndret og brent ned av tropper fra Gelderland. Gjenoppbyggingen sto ferdig i 1502 med sterkere festningsvoller og en ny borg. I 1543 falt derimot Eindhoven igjen da festningsverkene ikke ble vedlikeholdt på grunn av fattigdom.
En stor brann i 1554 ødela 75 % av byen, men i 1560 var byen bygd opp igjen med hjelp fra Vilhelm I av Oranien. Under åttiårskrigen skiftet Eindhoven eiere mellom nederlenderne og spanjolene flere ganger frem til 1583 da spanske styrker rev ned bymurene. Eindhoven ble ikke en del av Nederland før 1629. Under den franske okkupasjonen led Eindhoven igjen og mange bygg ble ødelagt av de invaderende styrkene. Eindhoven forble en liten by frem til begynnelsen av den industrielle revolusjonen.
Den eksplosive veksten til industrien i regionen og behovet for flere hjem for alle arbeiderne krevde store administrative endringer siden Eindhoven fremdeles var avgrenset av vollgravene fra middelalderen. I 1920 ble de fem nabokommunene Woensel, Tongelre, Stratum, Gestel en Blaarthem og Strijp innlemmet i kommunen Groot-Eindhoven (Stor-Eindhoven). Senere ble forstavelsen «Groot-» fjernet.
Tidlig på 1900-tallet ble industrien videre utviklet med bil- og lastebilfabrikken DAF.
Storskala bombetokt under andre verdenskrig for å støtte fallskjermjegere i å sikre broene i og rundt byen ødela store deler av Eindhoven. Gjenoppbyggingen etterlot få historiske rester og byen ble bygd opp igjen med mange høyhus. I 1960-årene ble det tatt lite hensyn til å ta vare på den historiske arven. Det ble bygd et nytt rådhus og det gamle nygotiske rådhuset fra 1867 ble revet for å gi plass til en hovedvei som aldri ble bygd.