Roye ble tatt i ed som Liberias president 3. januar 1870. Da Roye blei president var landet inne i en politisk ustabil periode, forsterka av økonomiske problemer. Roye begynte et gjenoppbyggingsprogram med intensjon om å bygge nye veier og skoler. For å få penger til dette seilte Roye til England, hvor han starta forhandlinger med banker i London om lån. Betingelsene på disse låna var stive; blant annet var renta på sju prosent. Roye godtok låna raskt uten å konsultere parlamentet. Liberia mottok rundt 90 000 dollar, mens det blei utstedt obligasjoner for 400 000 dollar.
På grunn av økende konkurranse på verdensmarkedet fra brasiliansk kaffe, europeiske sukkererter og dampbåter, klarte ikke Liberia å skape tilstrekkelige eksportinntekter, og klarte ikke å betale tilbake låna. Resesjon tvang Liberia til å inngå større og større lån. Nedgangen i liberisk eksport og mangelen på betalingsevne førte til mye utenlands innblanding i Liberia.
Roye blei avsatt i et statskupp 26. oktober 1871, før hans toårstermin skulle ha gått ut.[3]
Død
Det fins ingen spesifikke historiske nedtegnelser angående datoen eller omstendighetene rundt Royes død, men de fleste kilder sier at han blei drept 11. eller 12. februar 1872. Andre kilder påstår at han drukna 12. februar 1872 mens han prøvde å nå et britisk skip i havna ved Monrovia.
Et portrett av Roye i galleriet i presidentboligen i Monrovia angir 11. februar 1872 som dødsdato.[3]
