Dunfermline Athletic ble stiftet i 1885, og klubben tok i bruk East End Park som sin hjemmebane. Klubben ble valgt inn i Scottish Football League (Division 2) i 1912. Dunfermline Athletic holdt seg i 2. divisjon fram til 1927, med unntak av årene 1915–1921, da 2. divisjon var innstilt på grunn av første verdenskrig. De rykket første gang opp i øverste divisjon i 1927, men klarte bare to sesonger før de rykket ned igjen.
Først etter opprykket til øverste divisjon i 1958 greide Dunfermline Athletic å etablere seg blant de beste. 1960-tallet ble klubbens beste periode. I ligaen ble de nummer 3 (av 18 lag) i 1965 og 1969, men dette ble overgått av cupmesterskapene i 1961 (2-0 mot Celtic) og 1968 (3-1 over Heart of Midlothian).
Etter nedrykket i 1972 fulgte en dårligere periode. Klubben kom opp igjen etter bare én sesong i 2. divisjon, men da ligaen ble omstrukturert til tre divisjoner i 1975, rykket Dunfermline Athletic igjen ned i nye First Division (nivå 2). Året etter fulgte et nytt nedrykk, og de neste ti årene vekslet klubben mellom nivå 2 og 3. I 1987 var de tilbake igjen i øverste divisjon, men de greide ikke å etablere seg i toppen.
Fra 2000 fulgte noen relativt stabile sesonger i øverste divisjon, som kulminerte med 4.-plass (av 12 lag) i Premier League i 2004, cupfinale i 2004 og 2007, og ligacupfinale i 2006. Dunfermline Athletic rykket imidlertid ned i First Division i 2007.
Meritter og klubbrekorder
Beste ligasesong: 3.-plass (av 18 lag) i 1965 og 1969
Ferdigspilt
†Rangers er fratatt 10 poeng etter at klubben er satt under administrasjon.
††Rangers har ikke lisens av UEFA til å delta i Mesterligaen 2012/2013 eller Europaligaen da klubben var under administrasjon ved fristen 31. mars
†††Hearts kvalifisert som vinner av Scottish Cup
Rangering: 1. poeng, 2. målforskjell, 3. antall scorede mål.
Litteratur
Sky Sports Football Yearbook. Headline Publishing Group, London 2008. ISBN 978 0 7553 1820 9
Gordon Smailes: The Breedon Book of Scottish Football Records. Breedon, Derby 1995. ISBN 1-85983-020-X
Paul & Shirley Smith: The Ultimate Directory of English & Scottish Football Grounds. Yore Publications, Harefield 2005. ISBN 0954 783042