Biskopen av Conversano, Gregorio Falconieri, presteviet ham den 18. desember 1954. Han underviste så ved presteseminaret i Conversano. I 1961 ble han kalt til professor ved Seminari Pontifici dalla Congregazione. Han underviste i filosofihistorie, filosofisk teori, didaktikk, psykologi, sosiologi og politisk økonomi ved det pavelige fakultet for Sør-Italia (Pontificia Facoltà Teologica dell'Italia Meridionale, PFTIM) og ved det teologiske institutt i Molfetta i Puglia (Istituto Teologico «Regina Apuliae» di Molfetta). I 1969 grunnla han sammen med erkebiskopen av Bari, Enrico Nicodemo, Istituto Superiore di Teologia Ecumenica og var dets første generalsekretær. I 1964 ble han stedfortredende sekretær for den regionale italienske bispekonferanse for Puglia og i 1967 direktør des Istituto Pastorale Pugliese.
Da bispedømmene Termoli og Larino ble sammenslått den 30. september 1986 ble han første biskop av Termoli-Larino.
Erkebiskop
Den 7. desember 1988 ble han erkebiskop av Lecce, og innført i dette embede den 29. januar året etter. Han var fra 8. juni 1999 til 29. januar 2008 formann for den regionale italienske bispekonferanse i Puglia, og i 2001 var han medlem av bispesynoden i Roma.
Ruppi skrev for en rekke aviser, blant annet Corriere del Giorno og L'Osservatore Romano, og hadde segmenter på fjernsynsstasjonen Telenorba. Han var medlem av Puglias historiske selskap og offentliggjorde monografier og historiske arbeider. Presten Filippo Smaldone (1848–1923), som hadde virket for døvstumme (sordomuti) og andre trengende i Lecce, ble helligkåret i erkebiskop Ruppis tid der.[2]
Han fratrådte av aldersgrunner den 16. april 2009[3], og døde i 2011 på et pleiehjem i Locorotondo.[4]
