Kilians far var skomaker; han døde da sønnen bare var to år gammel. Etter skole- og videregående skoleår i Eltville og fra 1871 til 1877 i Hadamar og en tid som sanitetssoldat i militæret, studerte Kilian teologi og filosofi i Münster og München. Kilian gikk deretter på prestseminaret i Freiburg im Breisgau (seminaret i Limburg ble stengt på grunn av den antikatolske Kulturkampf i kongedømmet Preussen).
Kilians hovedanliggende var å styrke den pastorale omsorg i de store byene Frankfurt am Main og Wiesbaden i et ellers landlig bispedømme. Han oppmuntret religiøse ordener til å etablere seg i bispedømmet og etablerte den filosofisk-teologiske høyskole Sankt Georgen i Frankfurt am Main og presteseminar i Limburg som opplæringssentra.
Hans fødeby Eltville am Rhein gjorde ham til æresborger i 1921.[3]
Augustinus Kilian døde 30. oktober 1930 av en langvarig hjertesykdom. Hans etterfølger var Antonius Hilfrich.