De Vlaamse overheid bestaat uit verschillende overheidsdiensten, die gegroepeerd worden in 10 beleidsdomeinen. Een beleidsdomein bestaat uit een departement en een of meer agentschappen:
Het departement zorgt voor de beleidsvoorbereiding en de beleidsondersteuning. Het werkt onder het directe gezag en onder de verantwoordelijkheid van de minister.
Een agentschap is voornamelijk verantwoordelijk voor beleidsuitvoerende taken en heeft een grotere mate van autonomie. Daarom spreekt men ook over 'verzelfstandigde' agentschappen.
De structuur die die Vlaamse overheidsdiensten in beleidsdomeinen, departementen en agentschappen indeelt, werd in 2006 uitgedacht bij de grootschalige reorganisatie onder de noemer Beter Bestuurlijk Beleid (BBB). In de praktijk werken departementen en agentschappen nauw samen bij zowel beleidsvoorbereiding als beleidsuitvoering. Het departement betrekt de agentschappen bij de beleidsvoorbereiding en -evaluatie en toetst de beleidsvoornemens bij hen af. De agentschappen leveren beleidsgerichte input vanuit hun ervaring met beleidsuitvoering. Binnen een beleidsdomein zijn er verder nog een beleidsraad, een managementcomité en een strategische adviesraad.
Beleidsdomein Kanselarij, Bestuur, Buitenlandse Zaken en Justitie (KBBJ)
Beleidsdomein Werk, Economie, Wetenschap, Innovatie, Landbouw en Sociale Economie (WEWILS)
Sinds 1 januari 2024 zijn de beleidsdomeinen Economie, Wetenschap en Innovatie (EWI), Landbouw en Visserij (LV) en Werk en Sociale Economie (WSE) samengevoegd onder het nieuw beleidsdomein WEWILS.
Op 1 april 2017 werden de beleidsdomeinen Leefmilieu, Natuur en Energie en Ruimtelijke Ordening, Woonbeleid en Onroerend Erfgoed omgevormd tot het beleidsdomein Omgeving.