In 1899 richtte president William McKinley het Lake Tahoe Forest Reserve op, dat de basis vormde voor drie latere National Forests in het streek rond Lake Tahoe: Tahoe National Forest, Eldorado National Forest en Toiyabe National Forest. In 1973 richtte de Forest Service de Lake Tahoe Basin Management Unit op uit delen van die drie bosgebieden, als een bijzonder soort National Forest dat gerichter zou kunnen inspelen op de speciale eisen van dit grote bekken. De naam ging oorspronkelijk iets tijdelijks zijn, maar is uiteindelijk gebleven. De LTBMU verschilt van andere National Forests doordat het een kleinere oppervlakte heeft maar wel 78% van de oppervlakte in het bekken van Lake Tahoe beheert, waardoor het een grote rol kan spelen in de bescherming van het bekken en het ecosysteem. Daarnaast omhelst het gebied zowel natuurlijke als stedelijke omgevingen. Bovendien staat de LTBMU bekend als een pionier in het onderzoek naar ecosysteem- en bosbeheer.
