De Kerestalen zijn niet bewezen verwant aan andere taalfamilies. Edward Sapir schaarde de talen onder de Hokan-Siouxtalen. De Amerindische hypothese van Joseph Greenberg schaart Keres met Sioux, Irokees, Caddo en Yuchi onder de Keresioux-talen. Deze voorstellen worden in taalkundige kringen zelden aanvaard.