Joachim Eilers (Keulen, 2 april 1990) is een Duitse baanwielrenner. Hij is goed in de sprintonderdelen, de sprint, teamsprint, keirin en 1 km tijdrit. Eilers won de Europese titel op de teamsprint in 2012 en 2014, in 2014 was hij ook de beste op de keirin. Tijdens de Wereldkampioenschappen baanwielrennen in 2016 won hij de 1 km tijdrit en de keirin.
Eilers heeft deelgenomen aan de Olympische Zomerspelen van 2016 in Rio de Janeiro. Tijdens deze spelen behaalde hij een vierde plaats op de keirin en een vijfde plaats op zowel de teamsprint als de sprint.
