Noot:K. Beringen-Heusden-Zolder stond vorig seizoen lang op een degradatieplaats in Tweede Klasse, maar deze club werd uiteindelijk geschrapt. Er was dan ook geen andere rechtstreekse degradanten uit Tweede Klasse.
Gepromoveerde teams
Deze teams waren gepromoveerd uit de Vierde Klasse voor de start van het seizoen:
Noot: Door de schrapping van K. Beringen-Heusden-Zolder uit Tweede Klasse, was er een extra plaatsje vrijgekomen met de bijhorende verschuivingen. Als beste verliezer uit de eindronde mocht RFC Liège alsnog promoveren.
Promoverende teams
Deze teams promoveerden naar Tweede Klasse op het eind van het seizoen:
Verbroedering Geel won de eindronde die recht gaf op promotie. UR Namur diende omwille van licentieproblemen bij Geel klacht in. Na diverse zaken en procedures werden uiteindelijke beide ploegen tot Tweede Klasse toegelaten.
Degraderende teams
Deze teams degradeerden naar Vierde Klasse op het eind van het seizoen:
In Derde Klasse A stond tot halverwege de competitie Wetteren bovenaan als leider. Vanaf de 16de speeldag leed de ploeg echter zes nederlagen op rij, en zakte weg van de eerste plaatsen. De ploeg werd bijgehaald door onder andere Tournai. Diegem en Geel, dat met zes minpunten de competitie was begonnen, volgden op een zestal punten van RFC Tournai. Diegem kwam dichter, en op de 24ste speeldag kwamen beide ploegen gelijk bovenaan. Op de allerlaatste speeldag stonden beide clubs met evenveel punten aan de leiding, Geel volgde op twee puntjes. Diegem raakte niet verder dan een gelijkspel bij Wetteren. Doornik won vlot met 0-4 op het veld van Meerhout, en pakte zo toch de titel.
In Derde Klasse B pakte ROC de Charleroi-Marchienne vlot de titel. De club won de eerste twee periodetitels, en verzekerde zich op de voorlaatste speeldag ook van de eindzege.
Uit Derde Klasse A plaatsten periodekampioenen R. Cappellen FC en Verbroedering Geel zich voor de eindronde. Omdat de eerste periode door de uiteindelijke kampioen RFC Tournai was gewonnen, mocht ook K. Diegem Sport als derde in de eindstand naar de eindronde. In Derde Klasse B waren de eerste twee periodes door uiteindelijke kampioen R. Olympic Club de Charleroi-Marchienne gewonnen, de derde periode was door RFC Sérésien binnengehaald. RFC Sérésien had echter geen licentie voor de Tweede Klasse aangevraagd, en nam zo niet deel aan de eindronde. De eindrondeplaatsen gingen zo naar de nummers twee, drie en vier uit de eindstand, namelijk UR Namur, R. Sprimont Comblain Sport en White Star Woluwe FC.
Promotie-eindronde
Ronde 1
In de eerste ronde van de eindronde traden zes derdeklassers aan, die aan elkaar gepaard werden. De drie winnaars van elk heen- en terugduel gaan door naar de volgende ronde.
Datum
Uur
Wedstrijd
Uitslag
13/05/2007
16:00
R. Cappellen FC - R. White Star Woluwe FC
1-1
13/05/2007
16:00
KFC Verbroedering Geel - R. Sprimont Comblain Sport
1-0
13/05/2007
16:00
K. Diegem Sport - UR Namur
0-2
17/05/2007
15:00
UR Namur - K. Diegem Sport
2-0
17/05/2007
16:00
R. White Star Woluwe FC - R. Cappellen FC
1-2
17/05/2007
16:00
R. Sprimont Comblain Sport - KFC Verbroedering Geel
0-3
Ronde 2
In de tweede ronde wordt bij de drie winnaars van de eerste ronde de op twee na laatste uit Tweede Klasse gevoegd. Net als vorig seizoen was dit KFC Dessel Sport. Ook derdeklasser R. Cappellen FC had vorig seizoen deze tweede ronde gespeeld.
Datum
Uur
Wedstrijd
Uitslag
24/05/2007
20:00
UR Namur - R. Cappellen FC
2-1
24/05/2007
16:00
KFC Verbroedering Geel - KFC Dessel Sport
2-1
27/05/2007
16:00
R. Cappellen FC - UR Namur
0-2
27/05/2007
16:00
KFC Dessel Sport - KFC Verbroedering Geel
1-2
Finales
De winnaar van de finale promoveert naar Tweede Klasse.
Datum
Uur
Wedstrijd
Uitslag
03/06/2007
16:00
KFC Verbroedering Geel - UR Namur
2-0
10/06/2007
16:00
UR Namur - KFC Verbroedering Geel
0-1
Voor de plaatsen 3 en 4 werd nog een wedstrijd gespeeld. Wanneer er om extra-sportieve redenen bijkomende promotieplaatsen vrijkomen, heeft eerst de verliezend finalist, en vervolgens de winnaar van dit duel recht op promotie:
Datum
Uur
Wedstrijd
Uitslag
03/06/2007
16:00
R. Cappellen FC - KFC Dessel Sport
2-1
Degradatie-eindronde
De twee teams die 14de eindigden, Sporting West Ingelmunster-Harelbeke en RAA Louviéroise, speelden een eindronde met een aantal vierdeklassers en gingen daar van start in de tweede ronde van die eindronde.