Van zijn hand verschenen meer dan twintig werken waarvan zijn traktaat aangaande cryptografie hem de meeste roem opleverde. Men heeft naar aanleiding van dit traktaat onterecht het Vigenèrecijfer naar hem vernoemd.
Naast dit Traicte de Chiffres verschenen onder meer:
Traicte de Cometes
Traicte du Fev et du Sel
Literatuur
Kahn, David: The codebreakers, the comprehensive history of secret communication from ancient times to the internet 1996 ISBN 0684831309
Mendelsohn, Charles J.: Blaise de Vigenère and the "Chiffre Carré" 1940 (Google Boeken)