Benjamin Jowett (zo uitgesproken dat het rijmt met 'know it') werd geboren in Camberwell, een deel van Londen. Zijn vaders familie stamde uit Yorkshire. Deze familie maakte al drie generaties deel uit van de evangelische beweging binnen de Anglicaanse Kerk. Zijn moeder was een Langhorne, familie van John Langhorne, de dichter en vertaler van Plutarchus. Vanaf zijn twaalfde bezocht Jowett de St Paul's School (toen gevestigd aan het St Paul's-kerkhof). Op achttienjarige leeftijd verkreeg hij een open beurs voor Balliol College, aan welk instituut hij voor de rest van zijn leven verbonden zou blijven.