Desmarest publiceerde Histoire Naturelle des Tangaras, des Manakins et des Todiers (1805), Considérations générales sur la classe des crustacés (1825), Mammalogie ou description des espèces des Mammifères. Paris: Veuve Agasse (1820), en Dictionnaire des Sciences Naturelles (1816-30, met André Marie Constant Duméril). Zijn zoon, Eugène Anselme Sébastien Léon Desmarest, (1816-1889) was ook een zoöloog.