Krusenstern werd geboren in Estland en stierf er ook: zijn grafmonument bevindt zich in de dom van Tallinn.
Krusenstern woonde begin negentiende eeuw op het kasteel van Kiltsi. Hier is ook een klein museum.
Er is een krater op de maan naar hem genoemd, maar bekender is de Russische viermaster de Krusenstern, die regelmatig in de Nederlandse havens is te zien geweest bij manifestaties als Sail Amsterdam en Delfsail. De Krusenstern is het opleidingsschip van de Russische marine. Ook het oostelijke VS-eiland van de Diomedeseilanden in de Beringstraat (Kleine Diomedes) wordt in het Russisch Kroezensjtern genoemd.
