Dabartinių gyventojų protėviai į salas atsikėlė XI-XII a. Pradiniu laikotarpiu jie statė labai daug tvirtovių gusuku, kurių dalis yra įtrauktos į pasaulio paveldo sąrašą kaip Gusuku vietovės.
Salos, dabar priklausančios Japonijos Okinavos prefektūrai, kadaise priklausė nepriklausomai tautai – Riūkiū karalystei. Gera geografinė padėtis: lengvas susisiekimas su Japonija, Kinija ir kitom pietryčių Azijos šalimis lėmė sėkmingą prekybą, tačiau ilgą laiką Riūkiū karalystė turėjo mokėti duoklę Kinijai.
1609 m. Sacumos klanas, kuris kontroliavo dabartinės Kagošimos prefektūros teritoriją, užgrobė Riūkiū karalystę. Nuo tada Riūkiū karalystė turėjo mokėti duoklę ne tik Kinijai, bet dar ir Sacumai.
Sacuma darė didelę įtaką Riūkiū karalystei. Maždaug Meidži restauracijos laikotarpiu Japonija prisijungė buvusią karalystę kaip savo koloniją ir pavadino ją Okinava han. Okinava buvo paskelbta prefektūra tik 1879 m., tuo tarpu 1872 m. visos kitos Japonijos teritorijos buvo paskelbtos prefektūromis.
Prefektūrai priskiriamos ir negyvenamos Senkaku salos, ginčytinos su Kinija.
Klimatas ir gamta
Salos, priklausančios prefektūrai gali būti vulkaninės arba koralinės. Koralinės kilmės salose dėl lietaus erozijos čia atsirado daug uolų, kurios labai pagelbėjo Okinavos mūšio metu. Turistus ypatingai traukia plati klintinėGiokusendo ola.
Sakoma, kad Okinavos paplūdimiai – gražiausi Japonijoje. Klimatas taip pat labai tinkamas poilsiavimui – didžiąją metų dalį čia laikosi ne žemesnė kaip 20 °C temperatūra.
Vyrauja subtropinis klimatas, ir salose yra išlikę nemažai neliestos subtropinių lietaus miškų gamtos su didžiule biologine įvairove. Čia įkurti keli nacionaliniai parkai, tarp kurių yra Jambaru nacionalinis parkas ir Iriomotės-Išigakio nacionalinis parkas. Dvi prefektūrai priklausančios vietovės, Šiaurinė Okinava ir Iriomotė įtrauktos į pasaulio paveldo paminklų sąrašą.
Okinavos gyventojai pasižymi ilgaamžiškumu. Čia šimtamečių gyvena daugiau nei bet kur kitur Japonijoje, o vidutinė gyvenimo trukmė yra pati didžiausia pasaulyje: vyrai čia gyvena vidutiniškai 90 metų, moterys – net 93 metus. Teigiama, kad taip yra dėl to, jog Okinavos gyventojai daugiausiai minta žuvimi ir daržovėmis.
Pagrindiniai greitkeliai Okinavos prefektūroje – Okinavos autostrada. Taip pat svarbūs greitkeliai – Nahos oro uosto greitkelis ir 58, 329, 330, 331, 332, 390, 449, 505, 506 ir 507 plentai.
Geležinkeliai
Okinavos vienbėgis geležinkelis – vienintelis geležinkelis prefektūroje. Traukinys pakankamai negreitas – jo didžiausias greitis 65 km/h.
Uostai
Okinavos prefektūra turi daug uostų. Pagrindiniai šeši yra įsikūrę Nahoje, Untene, Kinvane, Nakagusukavane, Hirare ir Išigakyje.