Viduramžiais Obokas priklausė Ifato, Adalio sultonatams, vėliau jį valdė afarai. Prancūzų valdymo laikais Obokas buvo svarbus garlaivių anglies papildymo uostas, čia įsikūrė pirmoji Prancūzijos Somalilando administracija. 1894 m. administracija perkelta į Džibučio miestą, Oboko reikšmė sumenko.