Sprendimas dėl Baku stoties statybos priimtas 1880 m., pastatas suprojektuotas 1882 m., atidarytas 1883 m.[1]1926–1977 m. stotis buvo dviejose vietose – senoji Tbilisio vardu (pastatyta 1883 m.) ir Sabunči vardu (pastatytas 1926 m. vietiniams elektriniams traukiniams). 1977 m. stotis iš esmės rekonstruota pristatant naują priestatą prie Tbilisio vardo stoties. Nuo 2015 m. stotis vėl rekonstruota ir iškilmingai atidaryta 2017 m. vasario 10 d.[2]
