Piliakalnį iš pietų juosia upės slėnis, iš rytų ir vakarų – daubos. Aikštelė ovali, apie 30 x 26 m dydžio su ryškiu kultūriniu sluoksniu. Jos rytinis kraštas kiek žemesnis, šiauriniame krašte buvo supiltas pylimas (dabar išskleistas) ir iškastas griovys.
Piliakalnis datuojamas I tūkst. pr. m. e. – I tūkst. pr., įrengtas Pyvesos dešiniojo kranto aukštumos kyšulyje. Aikštelė ovali, pailga P-Š kryptimi, 30x26 m dydžio, žemesniu R kraštu. Bakšėnų piliakalnis žinomas jau gana seniai. Jis buvo įtrauktas į Fiodoro Pokrovskio „Kauno gubernijos archeologinį žemėlapį“, aprašė Jurgis Elisonas, Petras Tarasenka, Jonas Puzinas.
Š aikštelės krašte buvo supiltas pylimas ir už jo iškastas griovys (sunaikinti). Š papėdėje 0,5 ha plote yra papėdės gyvenvietė. Šalia piliakalnio buvo II – V a. Nodiejiškių pilkapynas (sunaikintas).