Tentamen agrostographiae universalis etc. Ordo I. II. — Pragae, 1838.
Bambuseae. — 1839.
Bambuseas monographice disposuit D-r F. I. Ruprecht // Mém. de L’Acad. Imp. des Sc. de St.-Pétersbourg, VI série, Sc. math. phys. et natur.. — 1840. — Т. V. — С. 91—164. — (libro editum Petropoli anno 1839)
Gramina Agrostidea etc., exposuerunt C. B. Trinius et F. J. Ruprecht // Mém. de l’Acad. Imp. des Sc., VI série. — 1842. — Т. VII, 2. — С. 1—189. (idem: Species graminum stipaceorum, Petrop., 1842)
Gramineae // Bulletin de l’Acad. royale des sс. et. belles lettres de Bruxelles. — 1842. — Вып. IX, 2. — С. 227—248.
Flores Samojedorum cisuralensium offert F. I. Ruprecht // Beiträge zur Pflanzenkunde des Russischen Reìchs. — 1845. — Вып. II.
Флора Северного Урала. О распространении растений на Северном Урале = Flora Borealo-Uralensis. Über die Verbreitung der Pflanzen im nördlichen Ural. — Petropoli, 1854.
Flora boreali-uralensis etc // Der nordliche Ural und das Küstengebirge Pae-choì etc., ч. II. — 1856.
Decas plantarum amurensium etc. — Petropoli, 1859.