2018년 1월 기준, 인도네시아 에어아시아는 다음의 노선을 운항 중이다.

• 마카오
  • 마카오 - 마카오 국제공항

• 말레이시아
  • 쿠알라룸푸르 - 쿠알라룸푸르 국제공항 허브
  • 페낭 - 페낭 국제공항
• 싱가포르
  • 싱가포르 - 싱가포르 창이 국제공항
• 인도네시아
  • 자카르카 - 수카르노 하타 국제공항 허브
  • 덴파사르 - 응우라라이 국제공항
  • 메단 - 쿠알라나무 국제공항
  • 반둥 - 후세인 사스트라네가라 국제공항
  • 수라바야 - 주안다 국제공항
  • 스마랑 -아흐마드 야니 국제공항
  • 욕야카르타 - 아디스킵토 국제공항
  • 파당 - 미낭카바우 국제공항 - (2018년 2월 9일 신규취항)
  • 팔렘방 - 술탄 마흐무드 바다루딘 2세 공항
• 태국
  • 방콕 - 돈므앙 국제공항

• 오스트레일리아
  • 다윈 - 다윈 국제공항 - (2018년 1월 28일 단항)
  • 퍼스 - 퍼스 공항

• 홍콩
  • 홍콩 - 홍콩 첵랍콕 국제공항

• 말레이시아
  • 코타키나발루 - 코타키나발루 국제공항
  • 조호르바루 - 세나이 국제공항
• 인도네시아
  • 롬복 - 롬복 국제공항
  • 마카사르 - 술탄 하사누딘 국제공항
  • 솔로 - 아디수마르모 국제공항
  • 페칸바루 - 술탄 샤리프 카심 2세 국제공항
• 태국
  • 푸켓 - 푸켓 국제공항

• 인도
  • 콜카타 - 네타지 수바시 찬드라 보스 국제공항