세르카니아스 역은 마드리드-아랑후에스 노선에 해당되는 C3호선이 지난다. 지하철역이 건설될 당시에 함께 건설되었고, 반대로 12호선의 세르카니아스 환승역 중에서 유일하게 새로 신설된 역이 되었다. 두 역 모두 2003년4월 11일 12호선의 전 구간 개통과 함께 문을 열었다.
2014년7월 6일부터는 12호선의 아로요 쿨레브로 역에서부터 로스 에스파르탈레스 역까지의 구간이 시설개선 공사로 운행을 일시중단하게 되었다. 해당 구간의 각 역에 있는 승강장 선로를 교체 개선하고 선로정비 체계를 대체하며, 터널 방수작업과 하수관 수용량 확대 등의 공사가 진행되었다. 또 해당 구간을 통과하는 열차의 속력을 시속 70km로 늘리게 되었다. 공사는 2014년 9월 8일에 마무리되었다.
