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글리세롤 3-인산 탈수소효소 (퀴논)
글리세롤 3-인산 탈수소효소 (퀴논)
식별자
EC 번호	1.1.5.3
CAS 번호	9001-49-4
데이터베이스
IntEnz	IntEnz view
BRENDA	BRENDA entry
ExPASy	NiceZyme view
KEGG	KEGG entry
MetaCyc	metabolic pathway
PRIAM	profile
PDB 구조	RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
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글리세롤 3-인산 탈수소효소 (NAD⁺)
글리세롤 3-인산 탈수소효소 (NAD+)
	사람의 글리세롤 3-인산 탈수소효소의 결정학적 구조
식별자
EC 번호	1.1.1.8
CAS 번호	9075-65-4
데이터베이스
IntEnz	IntEnz view
BRENDA	BRENDA entry
ExPASy	NiceZyme view
KEGG	KEGG entry
MetaCyc	metabolic pathway
PRIAM	profile
PDB 구조	RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
유전자 온톨로지	AmiGO / QuickGO
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NAD-의존성 글리세롤 3-인산 탈수소효소 N-말단

아르트로박터 종의 n-(1-D-카복실레틸)-L-노르발린 탈수소효소의 결정 구조

식별자

상징

NAD_Gly3P_dh_N

Pfam clan

가능한 단백질 구조:
Pfam	구조
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	구조 요약

NAD-의존성 글리세롤 3-인산 탈수소효소 C-말단

아르카에오글로부스 풀기두스(archaeoglobus fulgidus)의 글리세롤 3-=인산 탈수소효소의 구조

식별자

상징

NAD_Gly3P_dh_C

Pfam clan

가능한 단백질 구조:
Pfam	구조
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	구조 요약

글리세롤 3-인산 탈수소효소(영어: glycerol 3-phosphate dehydrogenase, GPDH)는 다이하이드록시아세톤 인산을 sn-글리세롤 3-인산으로 가역적 산화환원 전환하는 반응을 촉매하는 효소이다.^[2]

글리세롤 3-인산 탈수소효소는 탄수화물 대사와 지질 대사의 사이에서 중요한 연결 고리 역할을 한다. 또한 미토콘드리아의 전자전달계로의 주요 전자 공급원이다.

글리세롤 3-인산 탈수소효소에 대한 이전 용어로는 알파 글리세롤 3-인산 탈수소효소 및 글리세롤인산 탈수소효소 등이 있다. 그러나 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 기질이 알코올이 아닌 알데하이드인 글리세르알데하이드 3-인산 탈수소효소(GAPDH)와 동일하지 않다.

대사 기능

글리세롤 3-인산 탈수소효소는 지질 생합성에서 중요한 역할을 한다. 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 환원함으로써 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 글리세롤 3-인산을 글리세롤로 신속하게 탈인산화한다.^[3] 또한 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 미토콘드리아 내막을 가로질러 산화환원 전위를 유지하는 데 관여하는 효소 중 하나이다.^[3]

반응

NAD⁺/NADH 조효소 커플은 물질대사의 산화환원반응을 위한 전자 저장소 역할을 하며 한 반응에서 다른 반응으로 전자를 운반한다.^[5] 이러한 물질대사 반응의 대부분은 미토콘드리아에서 일어난다. 추가적인 사용을 위해 NAD⁺를 재생하려면 세포질의 NADH 풀을 재산화해야 한다. 미토콘드리아 내막은 NADH와 NAD⁺ 모두에 대해 불투과성이므로 이들은 세포질과 미토콘드리아 기질 사이에서 자유롭게 교환될 수 없다.^[4]

막을 가로질러 이 환원 당량을 이동시키는 한 가지 방법은 2가지 형태의 글리세롤 3-인산 탈수소효소를 사용하는 글리세롤 3-인산 셔틀을 이용하는 것이다.

세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH) 또는 GPD1은 세포질과 마주하는 미토콘드리아 외막에 국한되어 있으며 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 환원하는 것을 촉매한다.
이와 함께 미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH) 또는 GPD2는 세포질을 내려다보는 미토콘드리아 내막의 바깥쪽 표면에 묻혀 있으며 글리세롤 3-인산을 다이하이드록시아세톤 인산으로 산화하는 것을 촉매한다.^[6]

세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(가용성) 및 미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소에 의해 촉매되는 반응은 다음과 같다.

변형

글리세롤 3-인산 탈수소효소는 다음과 같이 두 가지 형태가 있다.

효소			단백질			유전자
EC 번호	이름	공여체 / 수용체	이름	세포 내 위치	약어	이름	기호
1.1.1.8	글리세롤 3-인산 탈수소효소	NADH / NAD⁺	글리세롤 3-인산 탈수소효소 [NAD⁺]	세포질	GPDH-C	글리세롤 3-인산 탈수소효소 1 (가용성)	GPD1
1.1.5.3	글리세롤 3-인산 탈수소효소	퀴놀 / 퀴논	글리세롤 3-인산 탈수소효소	미토콘드리아	GPDH-M	글리세롤 3-인산 탈수소효소 2 (미토콘드리아)	GPD2

다음의 사람 유전자는 글리세롤 3-인산 탈수소효소 활성을 갖는 단백질을 암호화한다.

글리세롤 3-인산 탈수소효소 1 (가용성)

식별자

상징

GPD1

HGNC

UniProt

다른 정보

Chr. 12 q12-q13

검색
구조	Swiss-model
도메인	InterPro

글리세롤 3-인산 탈수소효소 2 (미토콘드리아)

식별자

상징

GPD2

HGNC

UniProt

다른 정보

Chr. 2 q24.1

검색
구조	Swiss-model
도메인	InterPro

GPD1

세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPD1)는 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 환원시키는 NAD⁺ 의존성 효소이다.^[8] 동시에 NADH는 다음의 반응에서 NAD⁺로 산화된다.

결과적으로 NAD⁺는 추가적인 대사를 위해 재생된다.

GPD1은 2개의 소단위체로 구성되어 있으며,^[9] 다음과 같은 상호작용을 통해 다이하이드록시아세톤 인산 및 NAD⁺와 반응한다.

GPD2

미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPD2)는 글리세롤 3-인산에서 다이하이드록시아세톤 인산으로의 비가역적 산화를 촉매하고 동시에 2개의 전자를 FAD로 전달하여 FADH₂를 생성한다. GPD2는 4개의 동일한 소단위체들로 구성된다.^[10]

환경 스트레스에 대한 반응

연구에 따르면 글리세롤 3-이난 탈수소효소는 pH 변화에 대해 대부분 영향을 받지 않는다. 특정 pH 조건에서는 GPD1 또는 GPD2가 선호되지 않는다.
높은 염 농도(예: NaCl)에서 배지의 염도가 증가하면 반응으로 글리세롤이 축적되기 때문에 GPD1의 활성이 GPD2보다 향상된다.
온도의 변화는 GPD1과 GPD2 모두에게 유리한 것으로 보이지 않는다.^[11]

글리세롤 3-인산 셔틀

미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소와 세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 서로 협력하여 작동한다. 세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소에 의해 NADH는 NAD⁺로 산화되고 다이하이드록시아세톤 인산이 글리세롤 3-인산으로 전환된다. 일단 글리세롤 3-인산이 미토콘드리아 내막을 통해 이동하면 퀴논을 산화제로 사용하고 FAD를 보조 인자로 사용하는 미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소에 의해 다이하이드록시아세톤 인산으로 산화될 수 있다. 결과적으로 ATP 1분자에 필적하는 에너지의 순손실이 일어난다.^[7]

이러한 효소의 조합된 작용은 NAD⁺/NADH 비율을 유지하여 대사의 지속적인 작동을 가능하게 한다.

질병에서의 역할

NAD⁺/NADH 퍼텐셜을 유지하는 글리세롤 3-인산 탈수소효소의 기본적인 역할과 지질 대사에서의 역할을 글리세롤 3-인산 탈수소효소를 비만과 같은 지질 불균형 질환의 요인으로 만든다.

글리세롤 3-인산 탈수소효소의 활성 향상, 특히 GPD2는 글리세롤의 생산을 증가시킨다. 글리세롤은 지질 대사의 주요 소단위체이기 때문에 글리세롤이 풍부하면 세포 수준에서 트라이글리세라이드의 축적이 쉽게 증가할 수 있다. 그 결과 지방 조직이 형성되어 비만에 유리한 지방이 축적되는 경향이 있다.^[12]
글리세롤 3-인산 탈수소효소는 또한 브루가다 증후군에서 역할을 하는 것으로 밝혀졌다. GPD1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 전자전달계에 결함을 일으키는 것으로 입증되었다. 세포에서 NAD⁺/NADH 수준과의 이러한 충돌은 심장 나트륨 이온 통로 조절의 결함에 기여하는 것으로 믿어지며 유아기에 치명적인 부정맥을 유발할 수 있다.^[13]

약리학적 표적

미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 제2형 당뇨병의 1차 약물인 메트포르민에 의해 저해되는 것으로 생각된다.^[14]

생물학적 연구

사르코파가 바르바타(Sarcophaga barbata)는 미토콘드리아에서 글리세롤 3-인산의 산화를 연구하는 데 사용되었다. 글리세롤 3-인산은 피루브산과는 달리 미토콘드리아 기질로 들어가지 않는 것으로 밝혀졌다. 이것은 미토콘드리아 내막에 있는 글리세롤 3-인산 플라보단백질 산화환원효소를 찾는 데 도움을 준다.

구조

글리세롤 3-인산 탈수소효소는 두 개의 단백질 도메인으로 구성된다. N-말단 도메인은 NAD 결합 도메인이고, C-말단 도메인은 기질 결합 도메인으로 작용한다.^[15] 그러나 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 RNA 결합 및 안정성의 조절을 포함하여 여러 달빛(moonlighting) 활성을 나타낼 수 있기 때문에 이량체 및 사량체 계면 잔기는 글리세롤 3-인산 탈수소효소와 RNA의 결합에 관여한다.^[16]

같이 보기

각주

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↑ Ou X, Ji C, Han X, Zhao X, Li X, Mao Y, Wong LL, Bartlam M, Rao Z (Mar 2006). “Crystal structures of human glycerol 3-phosphate dehydrogenase 1 (GPD1)”. 《Journal of Molecular Biology》 357 (3): 858–69. doi:10.1016/j.jmb.2005.12.074. PMID 16460752.
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더 읽을거리

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외부 링크

equivalent entries:
- 의학주제표목 (MeSH)의 alphaGPDH
- GPDH
Yeast genome database GO term: GPDH 보관됨 2007-12-24 - 웨이백 머신

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