Awale setatsiyun iki nduwe telu jalur sepur karo jalur 2 marupakan sepur lurus. Wiwit jalur ganda segmen Waruduwur–Losari resmi dioperasikake mulai 17 Juni 2013[3], jumlah jalure tambah dadi papat. Jalur 2 didadikake sepur lurus kanggo arah Cirebon mawon, jalur 3 didadikake sepur lurus amung kanggo arah Semarang, lan jalur 4 ditambahake ing sisi kidul setatsiyun sebagai sepur belok anyar. Selain itu, sistem pasinyalan elektrik sing lawas uwis diganti karo sing anyar gawean PT Len Industri.
Operasional setatsiyun iki uwis dipindahake ning bangunan anyar berukuran luwih gedhe sing ana tepat ing sebelah kulon bangunan lawas. Bangunan lawas setatsiyun sing marupakan peninggalan Semarang–Cheribon Stoomtram Maatschappij (SCS) tetap dipertahankan, tapi uwis ora maneh digunakan.
Ning arah wetan setatsiyun iki, wonten percabangan ing arah Pabrik Gula Tersana Baru (milik PT RNI), sing saiki uwis nonaktif. Selain itu, luwih ke wetan maneh, wonten bekas Setatsiyun Pabedilan (Bedilan) sing uwis ora aktif amarga okupansi sing sitik. Seka setatsiyun iki wonten jalur lori minuju Setatsiyun Sindanglaut lan menggabung ke Waruduwur sing uwis dinonaktifkan wiwit zaman pendudukan Jepang.<ref>Nusantara., Tim Telaga Bakti; Indonesia., Asosiasi Perkeretaapian (1997). Sejarah perkeretaapian Indonesia (édhisi ka-Cet. 1). Bandung: Angkasa. ISBN9796651688. OCLC38139980.</ref