この項では、日本の淡水魚について記す。一時的淡水魚も含めるが、河川河口域まではいるものにする。干潟やマングローブ林などの汽水域も含む。外来種、変種、雑種も含む。種の下の位（亜種、変種）がある場合は、その種は含まない。和名は一般的なものにする。
凡例
記号
- 【外】・・・外来種
- 【絶】・・・絶滅種
- 【亜】・・・亜種
- 【変】・・・変種
- 【沖】・・・沖縄（琉球諸島）固有種
- 【北】・・・北海道固有種
- 【小】・・・小笠原固有種
- 【琵】・・・琵琶湖固有種
- 【固】・・・その他固有種
階級
- 括弧なし→絶対にある階級
- 括弧あり→一部にある階級
分類
ヤツメウナギ科
- カワヤツメ属
- ミツバヤツメ属
チョウザメ科
- チョウザメ属
- ダウリアチョウザメ属
ガー科
- レピソステウス属（学名：Lepisosteus）
- アトラクトステウス属（学名：Atractosteus）
カライワシ目
イセゴイ科
- イセゴイ属
ニシン目
ニシン亜目
カタクチイワシ科
エツ亜科
- エツ属
ウナギ目
ウナギ亜目
ウナギ科
ウツボ科
ウミヘビ科
イワアナゴ科
キュウリウオ目
キュウリウオ科
- キュウリウオ属
シラウオ科
アユ科
- アユ属
サケ目
サケ科
- タイヘイヨウサケ属(サケ属、オンコリンクス属)
- イトウ属
- イワナ属（サルベリヌス属）
- シロマス属(コレゴヌス属、ワカソ属)
- タイセイヨウサケ属(サルモ属)
コイ目
コイ上科
コイ科
クセノキプリス亜科
- ハクレン属
- ソウギョ属
- アオウオ属
- ワタカ属
- ヘミクルター属
- メガロブラマ属
- カワムツ属
- ハス属
- カワバタモロコ属
- ヒナモロコ属
タナゴ亜科
- タナゴ属
- バラタナゴ属
- アブラボテ属
コイ亜科
- コイ属
- フナ属
カマツカ亜科
- タモロコ属
- カマツカ属
- ゼゼラ属
- ツチフキ属
- ニゴイ属
- スゴモロコ属
- ムギツク属
- モツゴ属
- ヒガイ属
ウグイ亜科
- ウグイ属
- アブラハヤ属
- ピメファレス属
テンチ亜科
- テンチ属
ダニオ亜科（ラスボラ亜科）
- ダニオ属
ドジョウ上科
ドジョウ科
アユモドキ亜科
ドジョウ亜科
ドジョウ属
シマドジョウ属
アジメドジョウ属
タニノボリ科
フクドジョウ亜科
ナマズ目
ナマズ科
ギギ科
アメリカナマズ科
ロリカリア科
カリクティス科
アカザ科
トウゴロウイワシ目
アテリノプス科
アテリノプシス亜科
- オドンテステス属
ダツ目
サヨリ科
メダカ科
カダヤシ目
カダヤシ科
カダヤシ亜科
トゲウオ目
トゲウオ科
ヨウジウオ科
ボラ目
ボラ科
- ボラ属
スズキ目
スズキ亜目
タカサゴイシモチ科
サンフィッシュ科
オオクチバス亜科
- オオクチバス属（ブラックバス）
ブルーギル亜科
- ブルーギル属
スズキ科
- モロネ属
タイ科
ヘダイ亜科
- クロダイ属
アカメ科
- アカメ属
ヒメツバメウオ科
- ヒメツバメウオ属
テッポウウオ科
- テッポウウオ属
ユゴイ科
- ユゴイ属
シマイサキ科
- シマイサキ属
ベラ亜目
ティラピア科 （カワスズメ科）
- ティラピア属
- オレオクロミス属
- アルコケントルス属
- アストロノータス属
スズメダイ科
ソラスズメダイ亜科
- ソラスズメダイ属
キノボリウオ亜目
トウギョ科（オスフロネムス科）
ゴクラクギョ亜科
- ゴクラクギョ属
タイワンドジョウ亜目
タイワンドジョウ科
- タイワンドジョウ属
ハゼ亜目
ハゼ科
ゴビオネルス亜科
- マハゼ属
- ヌエハゼ属
- キヌバリ属
- ヒナハゼ属
- ゴマハゼ属
- アベハゼ属
- ノボリハゼ属
- ヨシノボリ属
- チチブ属
- ウキゴリ属
- ミミズハゼ属
- シロウオ属
- ヒモハゼ属
- ハスジマハゼ属
- ハゴロモハゼ属（イトヒキハゼ属）
- サルハゼ属
- スナゴハゼ属
ハゼ亜科
- ウロハゼ属
- ヒトミハゼ属
- クモハゼ属
- ヒメハゼ属
- キララハゼ属（スジハゼ属）
- フタスジノボリハゼ属
- クロコハゼ属
- ツムギハゼ属
- ウチワハゼ属
- トサカハゼ属
- サラサハゼ属
ボウズハゼ亜科
- ボウズハゼ属
- ナンヨウボウズハゼ属
- ヨロイボウズハゼ属
- ミナミハゼ属
オキスデルシス亜科
- トビハゼ属
- イレズミハゼ属
- インコハゼ属
ワラスボ亜科
- チワラスボ属 en:Taenioides
- ワラスボ属 en:Odontamblyopus
ドンコ科
- ドンコ属
ツバサハゼ科
- ツバサハゼ属
スナハゼ科
- スナハゼ属
- カワアナゴ属 Eleotris
- タナゴモドキ属
- タメトモハゼ属
ノコギリハゼ亜科
- ノコギリハゼ属
- ジャノメハゼ属
- ホシマダラハゼ属
オオメワラスボ科
クロユリハゼ亜科
カサゴ目
カジカ科
コチ科
カレイ目
カレイ科
カレイ亜科
- ヌマガレイ属
- イシガレイ属
フグ目
フグ科
フグ亜科
- トラフグ属
- オキナワフグ属
タウナギ目
タウナギ科
- タウナギ属
出典・脚注
- ^ ヤツメウナギなどの無顎類は魚類に含めないとする意見もある。
- ^ 志賀健司 2010 石狩のチョウザメ 石狩ファイル No.0122-01 2010年10月31日発行 https://www.city.ishikari.hokkaido.jp/museum/pdf/if0122.pdf
- ^ 現時点では、国内における繁殖は確認されていない。詳しくはガー目#琵琶湖などにおける繁殖の可能性とその影響についてを参照のこと
- ^ 汽水域に入ることもある
参考文献
関連項目
外部リンク