カエノラブディティス・エレガンス

Caenorhabditis elegans
C. elegans微分干渉顕微鏡
分類巌佐ほか (2013)
: 動物界 Animalia
: 線形動物門 Nematoda
: クロマドラ綱 Chromadoria
亜綱 : プレクトゥス亜綱 Plectia
上目 : ラブディティス上目 Rhabditica
: カンセンチュウ目(桿線虫目)
Rhabditida
: カンセンチュウ科(桿線虫科)
Rhabditidae
: カエノラブディティス属
Caenorhabditis
: カエノラブディティス・エレガンス
C. elegans
学名
Caenorhabditis elegans
(Maupas, 1900) Dougherty, 1953
シノニム
  • Rhabditis elegans Maupas, 1900
和名
エレガンスセンチュウ

カエノラブディティス・エレガンス Caenorhabditis elegans は、線形動物門クロマドラ綱プレクトゥス亜綱カンセンチュウ目カンセンチュウ科に属する線虫の1種[1]細胞系譜が明らかになっているなど、実験材料として非常に優れた性質をもつことから、モデル生物として広く利用されている[2]多細胞生物として最初に全ゲノム配列が解読された生物でもある[2]。生物学の研究者にとってなじみ深く、C. elegans で広く通じ、日本語でも C. エレガンス(シー・エレガンス)と書かれることが多い(詳細は後記)。体長約1 mmミリメートルで透明な体をもつ[3][4]

分類と名称

かつては線形動物門双腺綱双器綱に大別され[5][6]、うち双腺綱の桿線虫亜綱カンセンチュウ目カンセンチュウ科に分類されていた。しかし、分子系統解析により自然分類でないことが判明し[6]、現在では本種を含むカンセンチュウ目はクロマドラ綱プレクトゥス亜綱に分類されている[1]

本種ははじめ Maupas (1900) により桿線虫属(カンセンチュウ属、ラブディティス属)の Rhabditis elegans として記載された[7]。この属は寄生性の属で、ヒト桿線虫 Rhabditis hominis などが知られる[8]Caenorhabditis ははじめ Osche (1952) により、桿線虫属の亜属として設立され、Dougherty (1953) により属に格上げされた[9]。本種 C. elegansCaenorhabditisタイプ種である[9]

名称

学名 Caenorhabditis elegans の属名 Caenorhabditis は桿線虫 Rhabditis に「新しい」を意味する接頭辞 caeno- を付したものであり、「新桿線虫」を意味する[3]種小名elegansラテン語で「優美な」を意味する形容詞である[10]

本種は代表的なモデル動物であるため、C. elegans としてしばしば言及される。しかし、国際動物命名規約第4版において、ある学名に最初に言及するときはすべての構成要素を略さずに書くべきとされているため[11][12]、初めから略記するのは適切な引用方法ではない[注釈 1]

日本語では、学名ラテン語読みを音写したカエノラブディティス・エレガンス[13][14][15][16][17](カエノラブディチス・エレガンス[2][18]、ケノラブディティス・エレガンス[19])や、英語風にシーノラブディティス・エレガンス[20](セノラブディティス・エレガンス[21][22])という表記が用いられる。日本語でも通称として C. エレガンス[23][2][24][25][15][14](シー・エレガンス[1][5])と書かれることも多い。エレガンスセンチュウ[26](エレガンス線虫[27])やセノラブヂチス線虫[3]という和名が与えられることもある。

生態

線形動物門の伝統的分類における双器綱では自由生活性のものが多いが、本種が属する双腺綱の線虫は大半の種が寄生性である[5]。しかし、本種は自由生活性である[5]土壌に生息し細菌類を食べる細菌食性である。実験室では寒天培地上に生やした大腸菌を栄養源として飼育される。

ただし、その生息地は明確にされていない。本種を記載したフランスの動物学者、Émile Maupas は本種を2度採集しており、それはいずれもアルジェ空港近辺の腐植土からと記している。ところが、Félix & Braendle (2010) によると、彼女らが世界中の野外の土壌サンプルを相手にした範囲では、本種が採集されたことは1度もないという。その代わり、人為的に作られた堆肥からは比較的よく採集される。

形態

C. elegans の組織と器官系。

体細胞数は、雌雄同体成虫では正確に959個(ただしこれは核の数であり、表皮細胞は多核であるため細胞数はより少ない[28])、では1033個かそれを少し上回る数である[29][30][31][32]。古い文献では雄の細胞数を1031個とする記述が多く見られるが、2015年に左右一対のMCM神経の発見[31]が報告されたことで、雄の細胞数がこれよりも2個増えている。雌雄同体の腸内に共生微生物が豊富に存在する環境では、子の腸細胞が1–3個程度増加する可能性が報告されている[32]C. elegans の細胞数を数える際には、細胞融合によって多核細胞となる表皮細胞については細胞でなく細胞核を数えるが、細胞分裂を伴わない核分裂によって多核細胞となる腸細胞については細胞核でなく細胞を数えている[29][30]

神経筋肉消化管表皮生殖巣の組織や器官をもつ[24]。体表は角質下層が分泌する厚いクチクラに覆われる[24]。体内には擬体腔を持つ[24]。表皮の内側を縦走筋(体壁筋)が走る[3]

消化管は、口から食道、弁を通って腸、直腸を経て肛門と続く[24][3]食道は食道前部(corpus)、食道狭(isthmus)および栓がある後部食道球(postcorporal bulb)に分かれている[2][3]口器には可動の装飾がない[2]

神経系は感覚細胞と運動ニューロンからなる[3]腹側神経索が発達し、中枢である神経環が食道の中央部を囲っている[3][2]神経細胞はわずか302個で、7600個のシナプスが全て同定されている[33]。これだけの細胞で物理刺激に対する回避運動や、化学物質(塩化ナトリウムなど)や温度と餌を関連付けた学習ベンズアルデヒドなどの誘引性揮発性物質に対する順応などの行動を示す[34][35][36]。また、個々の神経がどの細胞とシナプスもしくはギャップジャンクションを形成しているかが透過型電子顕微鏡の連続切片像から完全に再構築されていることや、レーザーを照射して特定の神経細胞を破壊する実験などから、どの神経細胞がどのような行動に関わるかもある程度わかっている。

生殖

性染色体による性決定は XO 型である。XX の個体は雌雄同体(2種類の生殖細胞を持つ雌)になり、XO の個体はになる[37]

雄は陰茎肛門が共有した開口部を持ち、総排出口となる[2]。また、雄には交接嚢(bursa)が発達する[2]。精子は典型的な長い尾部を持った流線形ではなく、小さくて丸い鞭毛を持たない細胞で、アメーバ様の動きにより運動する[33]

雌雄同体は肛門とは別に陰門(vulva)を持つ[2]。雌雄同体(雌)は幼虫期に300個弱の精子を作り、成虫期になると形成する。精子は子宮内の受精嚢(貯精嚢)に保持し[2][33]、貯めておいた精子を使って自家受精を行う[33][37]。卵の細胞膜と精子が融合すると、新たに受精した卵ではキチンが急速に合成され、多精が抑制される[33]。受精卵は初期の分裂ののち、陰門から押し出される[33]

一個体が産卵する子孫は300匹弱である。雌雄同体であるため、実験上、遺伝的な背景を均一にすることに役立つ。一方、雄は約0.1% の割合で現れる。これと雌雄同体とを交配させることも可能である。

身体の半分以上の体積を占める生殖系列細胞は1000個を越えることもある。

発生

C. elegans の胚発生
C. elegans の発生ステージ

本種は全ての細胞系譜が透明な角皮を通して詳細に追跡されている[33]。そのため、胚内のそれぞれの細胞がどの細胞から生じたのか、どの組織形成に寄与するのかが明らかになっている[33]。また、脊椎動物とは異なり個体間の差異がほぼない[33]

受精卵は螺旋卵割を行い、幼生は親に似た直達発生を行う[6]は約14時間で孵化し、幼虫 (L1–L4) はクチクラ層の脱皮を4回繰り返し成虫になる。寿命は約1か月[38]

モデル生物としての C. elegans

モデル生物としての歴史は1970年代に始まる[28]。当時シドニー・ブレナー発生過程と神経系の問題が今後の生物学で重要な分野になると考えた。分子生物学の成功には、大腸菌などのモデル生物(取り扱いやすく、大量に培養可能で、遺伝学生化学的手法が使えるという性質をもっている)を使ったことが大きく関与していると考えた彼は、同様の特徴を持つ多細胞生物として C. elegans をモデル生物とすることを提案した。当初近縁種の C. briggsae[注釈 2]も候補にあげられていたが、ブレナーの好みで C. elegans になったとされる。

ブレナーが線虫を選んだのには、リチャード・ゴールドシュミットやテオドール・ボヴェリなどの胚発生学者による研究で、個体差の少ない細胞系譜によって生じる少数の細胞と比較的少ない染色体を持っていることを既に示していたことによる[28]。これらの条件により、発生に関与する遺伝子を同定することが可能で、細胞系譜の追跡が可能になる[28]

それ以前の発生生物学上のモデル生物としては古典的な発生学以来のウニイモリ、分化の過程に関しては細胞性粘菌キイロタマホコリカビ)がよく使われたが、前者はその体が大きく複雑に過ぎ、後者では体の構造がないに等しく、多細胞動物とは比較できない。そのため、後生動物でありながら体が小さく細胞種数が少なく、しかも自由生活性で培養がたやすいものが必要であり、C. elegans はこれらの条件に良く合っている[28]。本種は寄生性でない土壌線虫であり、シャーレの中で培養できる[28]。また、成虫や胚は透明であり、微分干渉顕微鏡にて容易に細胞を区別でき、細胞系譜を追いやすい[24]。胚発生が約16時間と早く[28]、世代時間も4日と短いため、変異の誘導が行いやすい[24]。更に、ほとんどが雌雄同体であり自家受精可能であるのに加え、低頻度で生まれる雄との交配も可能である[28]。現在では Caenorhabditis Genetics Center [39]に登録される研究室は400を越える。

C. elegans をモデル生物として確立し、器官発生とアポトーシスの遺伝制御に関する発見をした成果に対し、ブレナーおよびロバート・ホロビッツジョン・サルストンは2002年にノーベル生理学・医学賞を受賞した[24]

1990年にヒトゲノム計画のモデル系として、全ゲノム配列の決定が3年間のパイロットプロジェクトとして開始された。これはアメリカ国立衛生研究所MRC分子生物学研究所の資金提供によるものである。1994年の資金追加を経て、1998年に多細胞生物として初めて 97 Mb(メガベース、106 bp)の塩基配列読み取りが完了した。その結果、6本の染色体上に約19000個の遺伝子の存在が予測された。このゲノムサイズはヒトの約3.2 Gb などと比較して3%と小さく、研究に適している[24][33]。また、2003年末には近縁種である C. briggsae のゲノム解読もなされ、分岐年代や相同性等の研究にも用いられている[24]

また、2本鎖の RNA を導入すると、それと相同の配列を持つ遺伝子の発現が抑制されるという、RNAi と呼ばれる遺伝子抑制手法が初めて確立された生物でもある。1998年にアンドリュー・ファイアーらにより報告されたこの現象は siRNA の発見へとつながり、現在遺伝子治療でもっとも期待される手法の一つとなっている。RNAi という現象を発見した成果に対し、ファイアークレイグ・メローは2006年にノーベル生理学・医学賞を受賞した。

身体が透明で外来遺伝子の発現が容易であることから、蛍光レポーターなどの機能タンパク質の性能評価に適した多細胞生物である。マーティン・チャルフィーは、緑色蛍光タンパク質(GFP)C. elegans の機械刺激受容神経に発現させ、GFPを蛍光レポータータンパク質として異種生物に応用できることを示した[40]。この成果により、チャルフィーは下村脩ロジャー・Y・チエンとともに2008年にノーベル化学賞を受賞した。

2015年に九州大学の研究グループは、 C. elegans を使って、被験者の尿の臭いを利用して早期かつ高精度のがん検診に成功したことを発表した[41][42]

OpenWorm という、C. elegans を細胞レベルでシミュレーションする国際的なオープンサイエンスプロジェクトがある。

脚注

注釈

  1. ^ elegans(優美な)は種小名として一般的であり、Calosoma elegans鞘翅目)、Catapaecilma elegansChersotis elegans鱗翅目)、Carinostoma elegansザトウムシ目)、Centruroides elegansサソリ目)などの節足動物Coscinopleura elegans苔虫動物)、Ctenochasma elegans翼竜目)、Celeus elegansキツツキ目)などさまざまな動物が該当し、単に C. elegans だけ表記してもどの動物を指すか特定できない。
  2. ^ セノラブディティス・ブリッグサエ[21]や C. ブリグジー[24]と表記される。

出典

  1. ^ a b c 巌佐ほか 2013, p. 1587.
  2. ^ a b c d e f g h i j k 白山義久 (2000-11-30). “14. 線形動物門 Phylum NEMATODA”. 無脊椎動物の多様性と系統. バイオディバーシティ・シリーズ5. 裳華房. pp. 142–145. ISBN 4785358289 
  3. ^ a b c d e f g h 一戸 1984, pp. 121–124.
  4. ^ A 線虫とは何か”. iss.jaxa.jp. 2022年7月17日閲覧。
  5. ^ a b c d 藤田敏彦 著、太田次郎、赤坂甲治、浅島誠、長田敏行 編『動物の系統分類と進化』裳華房〈新・生命科学シリーズ〉、2010年4月28日、152頁。ISBN 978-4785358426 
  6. ^ a b c 嶋田大輔 著「線形動物・類線形動物―昆虫に匹敵する多様性の持ち主?」、公益社団法人 日本動物学会 編『動物学の百科事典』丸善出版、2018年9月30日、72–73頁。ISBN 9784621303092 
  7. ^ 中野隆文 著「種と学名,高次分類群―動物の名称と名称に関するルール」、公益社団法人 日本動物学会 編『動物学の百科事典』丸善出版、2018年9月30日、46–47頁。ISBN 9784621303092 
  8. ^ 寄生虫学会用語委員 (1995). 寄生虫和名表. 日本寄生虫学会. https://jsparasitol.org/wp-content/uploads/2015/12/wamei.pdf. 
  9. ^ a b Dougherty 1955, p. 133.
  10. ^ 平嶋義宏『生物学名命名法辞典』平凡社、1994年11月1日、87頁。ISBN 4582107125 
  11. ^ 動物命名法国際審議会 著、野田泰一・西川輝昭 編『国際動物命名規約 第4版 日本語版 [追補]』日本分類学会連合、東京、2005年10月(原著2000年)、27頁。ISBN 4-9980895-1-Xhttp://ujssb.org/iczn/index.html  「条25 勧告 25A. 略記. 公表された著作物中である学名に最初に言及するときは,すべての構成要素を略さずに書くべきである.その後,二語名や三語名の一部に略記を用いる場合,その略記はあいまいでないやり方で行うべきであり,それが短縮していない単語だと誤解されないようにするために,常に終止符(ピリオド)を添えるべきである.」
  12. ^ 動物命名法国際審議会 著、野田泰一・西川輝昭 編『国際動物命名規約 第4版 日本語版 [追補]』日本分類学会連合、東京、2005年10月(原著2000年)、111頁。ISBN 4-9980895-1-Xhttp://ujssb.org/iczn/index.html  「付録B 11. ある特定の著作物中で(その著作物の表題中で言及されている場合は,その言及を除いて)最初に言及した後は,二語名もしくは三語名中で属階級群名を略記した形で書いてもよい.」
  13. ^ 線虫に驚異的な加速耐性”. 日経サイエンス. 2021年7月10日閲覧。
  14. ^ a b 久原篤・太田茜『環境の酸素濃度が体の低温適応を調節する―複数の感覚情報を統合する神経の仕組みの理解に繋がる―』(プレスリリース)国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED)、2019年2月7日https://www.amed.go.jp/news/release_20190207.html2021年7月10日閲覧 
  15. ^ a b 低温環境に弱い線虫が氷点下で生き延びた!』(プレスリリース)国立研究開発法人産業技術総合研究所、2019年5月15日https://www.aist.go.jp/aist_j/press_release/pr2019/pr20190515/pr20190515.html2021年7月10日閲覧 
  16. ^ 気温上昇により線虫に多世代遺伝子変異が生じる』(プレスリリース)アメリカ科学振興協会、2017年4月20日https://www.eurekalert.org/pub_releases_ml/2017-04/aaft-5_1041717.php2021年7月10日閲覧 
  17. ^ ClCチャネルによる味覚応答の調節』(プレスリリース)東京大学大学院理学系研究科・理学部 広報室、2021年1月27日https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2021/7226/2021年7月10日閲覧 
  18. ^ 佐藤矩行 著「5章 比較分子発生生物学のすすめ」、岩槻邦男・馬渡峻輔 編『生物の種多様性』(2版)裳華房〈バイオディバーシティ・シリーズ1〉、1997年9月20日(原著1996年8月10日)、102–114頁。ISBN 4-7853-5824-6 
  19. ^ アンドリュー・ブラウン 著、長野敬+野村尚子 訳『はじめに線虫ありき そして、ゲノム研究が始まった』青土社、2006年2月20日。ISBN 4791762541 
  20. ^ ライフサイエンス実験 Space Aging”. 宇宙航空研究開発機構 (2015年4月13日). 2024年6月12日閲覧。
  21. ^ a b 水久保隆之・二井一禎 編『線虫学実験』京都大学学術出版会、2014年10月1日、263頁。ISBN 978-4876985388 
  22. ^ 江村忠秀; 大野美紀; 樫尾啓介; 三輪さつき; 長谷川浩一; 三輪錠司 (2005). “自活性土壌線虫の分離と措養および遺伝学の試み”. 生物機能開発研究所紀要 5: 11–19. 
  23. ^ 岩槻邦男『多様性からみた生物学』(4版)裳華房、2008年(原著2002年)、97頁。 
  24. ^ a b c d e f g h i j k 佐藤ほか 2004, pp. 67–70.
  25. ^ 巌佐ほか 2013, p. 523d.
  26. ^ 宇野知秀 (2014). “昆虫の低分子量GTP結合蛋白質(Rab)”. 蚕糸・昆虫バイオテック 83 (1): 25–30. https://www.jstage.jst.go.jp/article/konchubiotec/83/1/83_1_025/_pdf. 
  27. ^ 巌佐ほか 2013, p. 1398d.
  28. ^ a b c d e f g h ギルバート 2015, p. 174.
  29. ^ a b Sulston, J.E.; Horvitz, H.R. (1977-03). “Post-embryonic cell lineages of the nematode, Caenorhabditis elegans” (英語). Developmental Biology 56 (1): 110–156. doi:10.1016/0012-1606(77)90158-0. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/0012160677901580. 
  30. ^ a b Sulston, J.E.; Schierenberg, E.; White, J.G.; Thomson, J.N. (1983-11). “The embryonic cell lineage of the nematode Caenorhabditis elegans” (英語). Developmental Biology 100 (1): 64–119. doi:10.1016/0012-1606(83)90201-4. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/0012160683902014. 
  31. ^ a b Sammut, Michele; Cook, Steven J.; Nguyen, Ken C. Q.; Felton, Terry; Hall, David H.; Emmons, Scott W.; Poole, Richard J.; Barrios, Arantza (2015-10). “Glia-derived neurons are required for sex-specific learning in C. elegans” (英語). Nature 526 (7573): 385–390. doi:10.1038/nature15700. ISSN 0028-0836. PMC 4650210. PMID 26469050. http://www.nature.com/articles/nature15700. 
  32. ^ a b Ohno, Hayao; Bao, Zhirong (2020-11-14) (英語). Small RNAs couple embryonic developmental programs to gut microbes. doi:10.1101/2020.11.13.381830. http://biorxiv.org/lookup/doi/10.1101/2020.11.13.381830. 
  33. ^ a b c d e f g h i j ギルバート 2015, p. 175.
  34. ^ Mori, Ikue; Ohshima, Yasumi (1995-07). “Neural regulation of thermotaxis in Caenorhabditis elegans” (英語). Nature 376 (6538): 344–348. doi:10.1038/376344a0. ISSN 0028-0836. http://www.nature.com/articles/376344a0. 
  35. ^ Saeki, S.; Yamamoto, M.; Iino, Y. (2001-05-15). “Plasticity of chemotaxis revealed by paired presentation of a chemoattractant and starvation in the nematode Caenorhabditis elegans” (英語). Journal of Experimental Biology 204 (10): 1757–1764. ISSN 0022-0949. PMID 11316496. https://jeb.biologists.org/content/204/10/1757. 
  36. ^ Colbert, Heather A; Bargmann, Cornelia I (1995-04). “Odorant-specific adaptation pathways generate olfactory plasticity in C. elegans” (英語). Neuron 14 (4): 803–812. doi:10.1016/0896-6273(95)90224-4. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/0896627395902244. 
  37. ^ a b Wolff, Jennifer Ross; Zarkower, David (2008). “Somatic sexual differentiation in Caenorhabditis elegans”. Curr. Top Dev. Biol. 83: 1–39. doi:10.1016/S0070-2153(08)00401-8. 
  38. ^ 本田陽子 著「エイジング―老化:加齢に伴う機能低下」、公益社団法人 日本動物学会 編『動物学の百科事典』丸善出版、2018年9月30日、340–341頁。ISBN 9784621303092 
  39. ^ Caenorhabditis Genetics Center
  40. ^ Chalfie, M; Tu, Y; Euskirchen, G; Ward, W.; Prasher, D. (1994-02-11). “Green fluorescent protein as a marker for gene expression” (英語). Science 263 (5148): 802–805. doi:10.1126/science.8303295. ISSN 0036-8075. https://www.sciencemag.org/lookup/doi/10.1126/science.8303295. 
  41. ^ 九州大学プレスリリース (2015-3-12)
  42. ^ Hirotsu et al. 2015.

参考文献

外部リンク