Dal 1960 al 1966 Düttmann ricoprì la carica di direttore edilizio della città di Berlino Ovest; in questa veste firmò importanti progetti che ridisegnarono il volto di alcune zone cittadine dopo le distruzioni della seconda guerra mondiale.
Dal 1966 al 1970 fu professore alla Technische Universität; successivamente operò come libero professionista, spegnendosi nel 1983 a soli 62 anni d'età.
Werner Düttmann è considerato uno dei maggiori esponenti dell'architettura moderna del dopoguerra in Germania. La sconfitta delle sue idee architettoniche, criticate a partire dalla fine degli anni settanta, fu sancita dall'esposizione di architettura IBA 84, che introdusse i criteri della "ricostruzione critica" e del "rinnovamento urbano prudente".