Nato in Uruguay in una famiglia di origini armene, ha vissuto in Argentina fra i sette e i diciotto anni. Dopo una carriera come dirigente di un'impresa di combustibili e senza aver mai giocato a calcio a livello professionistico, Markarián decise di intraprendere la carriera di allenatore dopo aver assistito alla sconfitta della Nazionale uruguayana contro i Paesi Bassi durante i Mondiali del 1974.[1]
Nonostante tale decisione fosse stata assunta per via del desiderio di migliorare il calcio charrua, Markarián non ha mai guidato nessuna squadra del suo Paese.
Carriera
Allenatore
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Ha allenato negli anni '80 l'Olimpia - con cui vinse due campionati nazionali - e il Club Cerro Porteño in Paraguay e negli anni '90 l'Universitario e lo Sporting Cristal in Perù, riuscendo a vincere il campionato sia con il primo che con il secondo, che condusse pure alla finale della Coppa Libertadores nel 1997.
El Mago vanta anche due esperienze nel calcio greco: ha infatti condotto lo Ionikos alla qualificazione alla Coppa Uefa nel 1999 e il Panathinaikos ai quarti di finale della Coppa UEFA nel 2003.
Ha inoltre portato la Nazionale paraguayana under-23 alla vittoria del Torneo Pre-Olimpico CONMEBOL 1992 e quella maggiore alle qualificazioni ai Mondiali del 2002. Il suo ultimo titolo è stato conquistato alla guida dell'Universidad de Chile, squadra con la quale ha vinto il Campionato di Apertura cileno nel 2009 battendo in finale la Unión Española.
Il 12 febbraio 2015 è stato nominato commissario tecnico della Grecia[3]. Il 7 agosto decide di dimettersi da CT della Grecia risolvendo consensualmente il contratto.
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