Il titolo d'Austria-Este gli fu dato poiché l'ultimo dei discendenti della famiglia d'Este, Francesco V, morendo senza lasciare figli, lasciò in eredità i suoi averi al cugino Francesco Ferdinando, imponendogli di dare la denominazione "d'Asburgo-Este" (secondo alcune fonti "d'Austria-Este"), ai suoi discendenti. Tuttavia dopo l'uccisione di Francesco Ferdinando lo zio di quest'ultimo, l'imperatore dell'Impero austro-ungaricoFrancesco Giuseppe d'Austria, trasmise i diritti estensi al nipote, l'arciduca Carlo, che il 16 aprile 1917 diede il titolo al figlio secondogenito Roberto.
Dal matrimonio tra Roberto e Margherita di Savoia-Aosta nacquero cinque figli:
Maria Beatrice d'Austria-Este (11 dicembre 1954), ha sposato il conte Riprand von Arco-Zinneberg, pronipote dell'ultimo re di Baviera, Ludovico III di Baviera, dal quale ha avuto:
Anna Teresa von Arco-Zinneberg (1981), sposata con figli;
Margherita von Arco-Zinneberg (1983), sposata;
Olimpia von Arco-Zinneberg (1988), ha sposato nel 2019 Giovanni Cristoforo Bonaparte;