Nel corso degli anni e sino al 1997 Mannisenmäki si alternò con vari piloti suoi connazionali (tra cui Sebastian Lindholm e Tapio Laukkanen), partecipando saltuariamente a gare del mondiale (soprattutto il Rally di Finlandia) e principalmente al Campionato Europeo, dove totalizzò 24 gare disputate e un podio, il terzo posto ottenuto all'Hankiralli, in Finlandia, nel 1990 con Lindholm.
Dal 1998 al 2001 partecipò al mondiale a tempo pieno, gareggiando in coppia con Tommi Mäkinen per la squadra ufficiale Mitsubishi e vincendo due campionati del mondo, nel 1998 e nel 1999, a bordo di diversi modelli della Lancer Evolution; fu quinto nel 2000 e terzo nel 2001. Il sodalizio tra i due si sciolse dopo il Tour de Corse 2001, quando entrambi incorsero in un brutto incidente: la loro Mitsubishi Lancer WRC urtò infatti un muretto a bordo strada e volò contro la parete opposta, capottandosi. Mannisenmäki rimase ferito nell'occasione e fu costretto a un momentaneo ritiro, che lo tenne lontano dalle corse per tutto il 2002[1].
