PyMOL

PyMOL
software
Logo
Logo
Schermata di esempio
Schermata di esempio
Un'immagine di PyMOL in esecuzione
GenereComputer grafica 3D
Bioinformatica
SviluppatoreDeLano Scientific LLC, Schrödinger LLC
Data prima versione2010
Ultima versione3.0.0 (9 aprile 2024)
Sistema operativoMultipiattaforma
LinguaggioPython
ToolkitPyQt
LicenzaLicenza Python
(licenza libera)
Sito webwww.pymol.org
Modifica dati su Wikidata · Manuale

PyMOL è un software libero di grafica 3D utilizzato per la rappresentazione di biomolecole in biochimica e bioinformatica.[1] Oltre all'uso più importante nella biologia strutturale, formati di dati comuni consentono a PyMOL di girare su sistemi operativi diversi, con un rendering della grafica di alta qualità. La parte iniziale del nome, Py, si riferisce al linguaggio di programmazione Python utilizzato dal programma.

Oltre alle versioni per Linux, Microsoft Windows e macOS sono disponibili anche versioni per IRIX e Solaris. Il programma è di solito installato su singoli computer, ma può essere installato su un file server per una rete locale soprattutto su Linux e Unix.

Storia

PyMOL è stato sviluppato dal biofisico statunitense Warren Lyford DeLano a partire dal 1998 e reso disponibile su Internet nel 2000. La sua intenzione era di creare un piccolo programma gratuito di facile utilizzo per la ricerca accademica e l'industria farmaceutica allo scopo di produrre le immagini in 3D di molecole di piccole dimensioni e grandi proteine o acidi nucleici ad alta risoluzione. Un prerequisito per il successo di PyMOL era costituito dalla possibilità di essere utilizzato da diversi sistemi operativi. Con la fondazione della DeLano Scientific LLC nel 2003 PyMOL era stato commercializzato rinunciando alla strategia open source.

Nell'agosto 2006, la DeLano Scientific, rese disponibile il download controllato di una versione precompilata di PyMOL.[2] L'accesso a queste versioni è controllato con l'acquisizione delle licenze. I prezzi della sottoscrizione variano a seconda della categoria in cui rientra l'acquirente, ad esempio se l'utilizzo è previsto in ambito accademico piuttosto che industriale. Inoltre, è disponibile anche una versione gratuita di PyMOL, dove l'utente dà un contributo volontario di sponsorizzazione. In generale, è permesso l'uso libero da parte degli studenti e degli insegnanti in scuole e università.

L'8 gennaio 2010 il progetto PyMOL, dopo la morte di Delano, è stato acquistato dall'azienda Schrödinger LLC che continuerà a sostenere attivamente la comunità open source di PyMOL.[2][3]

Note

  1. ^ Barry A. Bunin, Brian Siesel, Guillermo Morales, Chemoinformatics: theory, practice, & products, Springer, 2007, p. 208, ISBN 978-1-4020-5000-8. URL consultato il 20 giugno 2010.
  2. ^ a b (EN) PyMOL News
  3. ^ (EN) Schrödinger Acquires PyMOL Archiviato l'8 ottobre 2016 in Internet Archive.

Altri progetti

Collegamenti esterni

  Portale Biologia

Read other articles:

George Adriaan Deneve

Artikel ini sebatang kara, artinya tidak ada artikel lain yang memiliki pranala balik ke halaman ini.Bantulah menambah pranala ke artikel ini dari artikel yang berhubungan atau coba peralatan pencari pranala.Tag ini diberikan pada Oktober 2022. George Adriaan de Neve adalah seorang ahli gunung berapi[1] Indonesia. Sejak 1952, ia sudah meramalkan gunung Colo di Sulawesi Tengah akan meletus hebat. Ramalannya ternyata benar terjadi, seperti terbukti pada akhir Juni 1983. Setelah itu, ia ...

 

Ping An Insurance

Chinese insurance company This article has multiple issues. Please help improve it or discuss these issues on the talk page. (Learn how and when to remove these template messages) This article relies excessively on references to primary sources. Please improve this article by adding secondary or tertiary sources. Find sources: Ping An Insurance – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (March 2022) (Learn how and when to remove this template messag...

 

Butalbital

Barbiturate drug used for headaches ButalbitalClinical dataAHFS/Drugs.comMicromedex Detailed Consumer InformationMedlinePlusa601009Routes ofadministrationBy mouthATC codenoneLegal statusLegal status BR: Class B1 (Psychoactive drugs)[1] CA: Schedule IV DE: Anlage II (Authorized trade only, not prescriptible) UK: Class B US: Schedule III UN: Psychotropic Schedule III Pharmacokinetic dataBioavailability20-45%MetabolismLiver mainly CYP3A4Elimination half...

Perlombaan senjata laut Inggris-Jerman

Besar dan kekuatan kapal perang berkembang pesat sebelum, selama, dan sesudah Perang Dunia I. Hal ini disebabkan oleh persaingan di antara negara-negara maritim (termasuk Inggris dan Jerman) yang diakhiri oleh Traktat Laut Washington dan Traktat Versailles. Perlombaan senjata laut Inggris-Jerman berlangsung pada awal abad ke-20 dan merupakan salah satu penyebab Perang Dunia I. Pada saat yang sama, beberapa negara lain juga membangun angkatan lautnya, seperti Amerika Serikat, Jepang, dan beber...

 

أور ولوار (إقليم فرنسي)

أور ولوار    علم شعار الاسم الرسمي (بالفرنسية: Eure-et-Loir)‏    الإحداثيات 48°20′00″N 1°25′00″E / 48.333333333333°N 1.4166666666667°E / 48.333333333333; 1.4166666666667  [1] تاريخ التأسيس 4 مارس 1790  تقسيم إداري  البلد فرنسا[2][3]  التقسيم الأعلى سانتر-فال دو لوار  العا...

 

Alessandra Borchi

Italian cyclist Alessandra BorchiPersonal informationBorn (1983-08-15) 15 August 1983 (age 40)Team informationDisciplineTrack cyclingRoleRiderRider typeenduranceProfessional teams2006Nobili Rubinetterie Menikini Cogeas2008Cycling Team Titanedi-Frezza Acca Due O Alessandra Borchi (born 15 August 1983) is an Italian female track cyclist, and part of the national team. She competed in the team pursuit event at the 2009 UCI Track Cycling World Championships.[1] References ^ 2009...

دوريس سالامو

دوريس سالامو معلومات شخصية الاسم الكامل دوريس سالامو فواكومبوتو الميلاد 18 أبريل 1984 (العمر 39 سنة)كينشاسا، زائير الطول 1.75 م (5 قدم 9 بوصة) مركز اللعب الهجوم الجنسية جمهورية الكونغو الديمقراطية  معلومات النادي النادي الحالي النادي الأهلي المسيرة الاحترافية1 سنوات ف...

 

Mewar

Peta wilayah Mewar. Mewar atau Mewāḍ (Hindi: मेवाड़) adalah sebuah wilayah yang terletak di Rajasthan selatan-tengah di India barat. Wilayah ini mencakup Distrik Bhilwara, Chittorgarh, Rajsamand, Udaipur, dan Pratapgarh. Mewar berbatasan dengan Pegunungan Aravali di barat laut, Ajmer di utara, Gujarat dan Vagad di selatan, Malwa di tenggara, dan Hadoti di timur. Wilayah ini pernah dikuasai oleh Kerajaan Mewar (atau Udaipur) selama berabad-abad; kerajaan ini kemudian menjadi wil...

 

Why Him?

2016 American filmWhy Him?Theatrical release posterDirected byJohn HamburgScreenplay by John Hamburg Ian Helfer Story by Jonah Hill John Hamburg Ian Helfer Produced by Shawn Levy Dan Levine Ben Stiller Jonah Hill Starring James Franco Bryan Cranston Megan Mullally Zoey Deutch Cedric the Entertainer Griffin Gluck Keegan-Michael Key CinematographyKris KachikisEdited by William Kerr Dean Zimmerman Music byTheodore ShapiroProductioncompanies Red Hour Productions 21 Laps Entertainment 75 Year Pla...

Ibrahim Abdul Razak

Questa voce sull'argomento calciatori ghanesi è solo un abbozzo. Contribuisci a migliorarla secondo le convenzioni di Wikipedia. Segui i suggerimenti del progetto di riferimento. Ibrahim Abdul Razak Nazionalità  Ghana Altezza 180 cm Calcio Ruolo Centrocampista, attaccante Termine carriera luglio 2016 CarrieraGiovanili  Hapoel Ra'ananaMighty J.K. Club AalborgMalitSquadre di club1 1999 Liberty Prof.? (?)1999-2000 Aalborg? (?)2000-2001 Castelfiorentino9 (1)2...

 

White-winged dove

Species of bird in North America, Caribbean White-winged dove Perching on a saguaro cactus in Tucson, Arizona Conservation status Least Concern  (IUCN 3.1)[1] Scientific classification Domain: Eukaryota Kingdom: Animalia Phylum: Chordata Class: Aves Order: Columbiformes Family: Columbidae Genus: Zenaida Species: Z. asiatica Binomial name Zenaida asiatica(Linnaeus, 1758) Purple : Year-roundOrange : BreedingBlue : Nonbreeding Synonyms Columba asiatica Linnaeus,&...

 

华盛顿州

  关于与「华盛顿州」標題相近或相同的条目页，請見「华盛顿」。   此條目介紹的是美國西北部太平洋沿岸的州。关于与之同名的美国首都所在地，请见「華盛頓哥伦比亚特区」。 此條目需要擴充。 (2007年9月26日)请協助改善这篇條目，更進一步的信息可能會在討論頁或扩充请求中找到。请在擴充條目後將此模板移除。 华盛顿州 美國联邦州State of Washington...

Apple

Pour les articles homonymes, voir Apple (homonymie). Ne doit pas être confondu avec Apple Corps ou Apple Records. Apple Logo d'Apple. Apple Park, siège social d'Apple à Cupertino en Californie. Création 1er avril 1976[1] Fondateurs Steve Wozniak, Ronald Wayne[2],[3] et Steve Jobs[3] Forme juridique Corporation (d) et société anonyme avec appel public à l'épargne Action NASDAQ (AAPL) et bourse de Tokyo (6689) Slogan Think different Siège social Cupertino, Californie États-Unis ...

 

Bataille de Mu'tah

Bataille de Mu'tah Vestiges archéologiques de la bataille en 2013 Informations générales Date Septembre 629 / Jumada al-Awwal 8 AH Lieu Mu'tah (en), à l'est du Jourdain et d'al-Karak Issue Victoire byzantine[1],[2],[3],[4] Changements territoriaux Influence musulmane parmi les tribus arabes de la région Belligérants Empire byzantin Ghassanides Arabes musulmans Commandants Théodore Héraclius Churahbil ibn Amr (en) Zayd ibn Haritha 💀 Jafar ibn Abi Talib 💀 Abd Allah ibn ...

 

Dakishimeru

Dakishimeru抱きしめるSingel oleh BoAdari album OutgrowDirilis23 November 2005FormatSingel CDDirekam?GenrePopLabelavex traxProduserKazuhiro Hara Dakishimeru (抱きしめるcode: ja is deprecated ) adalah singel solo Jepang BoA ke-17. Singel ini adalah singel BoA dari album Outgrow. Lagu 抱きしめる (Dakishimeru) (Kazuhiro Hara) [Natsumi Watanabe] Before you said goodbye to me (Kazuhiro Hara) [?] 抱きしめる (Dakishimeru) (TV Mix) (Kazuhiro Hara) Before you said goodbye to me (TV ...

Rollyo

This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unsourced material may be challenged and removed.Find sources: Rollyo – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (July 2008) (Learn how and when to remove this message) Rollyo Rollyo was a Yahoo!-powered search engine which allowed users to register accounts and create personalized search engines. Each search engine cou...

 

Bungli

Bungli Klasifikasi ilmiah Domain: Eukaryota Kerajaan: Plantae (tanpa takson): Tracheophyta (tanpa takson): Angiospermae (tanpa takson): Eudikotil (tanpa takson): Asterid Ordo: Lamiales Famili: Bignoniaceae Tribus: Oroxyleae Genus: OroxylumVent. Spesies: Oroxylum indicum(L.) Benth. ex Kurz Sinonim[2] Arthrophyllum ceylanicum Miq. Arthrophyllum reticulatum Blume ex Miq. Bignonia indica L. Bignonia lugubris Salisb. Bignonia pentandra Lour. Bignonia quadripinnata Blanco Bignonia tripinna...

 

الدوري البيلاروسي الممتاز 2018

الدوري البيلاروسي الممتاز 2018 تفاصيل الموسم الدوري البيلاروسي الممتاز  النسخة 28  البلد بيلاروس  التاريخ بداية:30 مارس 2018  نهاية:2 ديسمبر 2018  المنظم اتحاد بيلاروس لكرة القدم  البطل باتي بوريسوف  مباريات ملعوبة 240   عدد المشاركين 16   الدوري البيلاروسي الم...

蘇格蘭國民信託

蘇格蘭國民信託National Trust for Scotland成立時間1931年類型慈善组织、國民信託法律地位信託總部愛丁堡服务地区蘇格蘭領導人Neil Oliver收入51,917,000 英镑 (2022年) 捐款25,752,000 英镑 (2022年) 員工数760 (2022年) 網站www.nts.org.uk 蘇格蘭國民信託（英語：National Trust for Scotland，蘇格蘭蓋爾語：Urras Nàiseanta na h-Alba），全稱為蘇格蘭歷史文物和自然風景信託，是蘇格蘭的一個以�...

 

Donnas

Disambiguazione – Se stai cercando altri significati, vedi Donnas (disambigua). Donnascomune(IT) Comune di Donnas(FR) Commune de Donnas Donnas – VedutaPanorama dal Bec di Nona LocalizzazioneStato Italia Regione Valle d'Aosta ProvinciaNon presente AmministrazioneSindacoAmedeo Follioley (lista civica Un pays à vivre) dal 24-5-2010 Lingue ufficialiFrancese, italiano TerritorioCoordinate45°36′N 7°46′E45°36′N, 7°46′E (Donnas) Altitudine352 m s.l....