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Pancryptista

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Pancryptista
Cryptophyta
Intervallo geologico
Classificazione scientifica
DominioEukaryota
SottodominioBikonta
SupergruppoEubikonta
Brown et al., 2013[1]
GruppoDiaphoretickes
SottogruppoEuDiaphoretickes
SuperregnoPancryptista[2]
Regni

Pancryptista è un superregno che include i due regni Cryptista e Microhelida, quest'ultimo contenente una sola specie, Microheliella maris. Le analisi filogenomiche del 2022 suggeriscono che Microhelida sia un regno fratello di Cryptista, formando insieme il superregno chiamato Pancryptista, che sarebbe il superegno fratello di Archaeplastida , insieme compresi nell'infragruppo CAM[2][3]

Morfologia

La maggior parte dei membri ha fino a 2 flagelli. I loro ejectosomi (un particolare organulo cellulare di difesa presente nelle alghe Cryptophyta (o criptomonadi)) occupano una parte significativa del loro volume.[3] Le creste mitocondriali di Tetradimorpha (un genere ancestrale di Cryptista incertae sedis, detto anche Tetrahelia, contenente la sola specie Tetradimorpha pterbica, forse di transizione fra Cryptista stesso e Microhelida) e Microheliella sono tubulari, mentre quelle di Cryptophyta e Palpitomonas sono piatte.[4]. La zona di transizione di Cryptista può avere 1-3 lamelle, limitatamente alle lamelle di transizione inferiori.[4]

Habitat

Microheliella e Tetradimorpha vivono in acque a bassa salinità, la prima negli estuari e la seconda nelle paludi di mangrovie.[4]

Storia

Cryptista è stato descritto per la prima volta nel 1989 da Thomas Cavalier-Smith,[3] ed è stato perfezionato più volte da allora. Secondo la sua definizione basata sui nodi del 2019, è un clade che si dirama dall'ultimo antenato comune dei generi Cryptomonas, Goniomonas, Katablepharis e Palpitomonas[3], e il nome non dovrebbe essere usato per gruppi che includono, ad esempio, Telonema subtile, Gephyrocapsa huxleyi, Chlamydomonas reinhardtii o Glaucocystis nostochinearum.[3]

Una specie basale, Palpitomonas bilix, è stata descritta nel 2010 da Yabuki, Inagaki e Ishida,[5] a Microheliella marist Cavalier-Smith és Chao 2012-ben írták le.[6] e Microheliella maris è stata descritta nel 2012 da Cavalier-Smith e Chao.[7] Ez utóbbiról azonban kiderült, hogy a Rhizaria Endomyxa törzsének tagja.[8]

In uno studio del 2018 di Cavalier-Smith et al.,[3] hanno dimostrato la monofilia di Corbihelia, che comprende Microheliella, Telonema e Picomonas, con una probabilità dell'84%, e che Minchinia è un membro dei Cryptista.[5]. Tuttavia, quest'ultimo è risultato essere un membro del phylum Rhizaria (subphylum Endomyxa).[6]

Negli studi del 2019 di Adl et al.[3] e Burki et al.[9], Pancryptista non è stato incluso come gruppo tassonomico e Microheliella maris è stato elencato come incertae sedis.

In un articolo del 2022 pubblicato su Cryptista, Thomas Cavalier-Smith ha creato la classe Endohelia [4], contenente Microheliella maris e forse Tetrahelia pterbica, successivamente classificato nella famiglia incertae sedis Tetradimorpha del regno Cryptista, e precedentemente invece classificato nel phylum Rhizaria del regno SAR.

Nel 2019, Yazaki et al. hanno determinato che Microheliella maris è così diverso da Cryptista da non esserne un membro,[10]: 29 mentre nel 2022, Yazaki et al. hanno determinato che M. maris è il gruppo fratello di Cryptista sulla base di 319 geni per un totale di 88.592 residui di amminoacidi. Hanno anche determinato che Archaeplastida è il gruppo fratello di Pancryptista, creando il clade Cam .[2]

Stile di vita

I Cryptista sono costituiti da fagotrofi batterivori o mixotrofi,[3] tra cui Microheliella maris, che è un fagotrofo.

Filogenetica

Esterna

Yazaki et al. nel 2022 hanno creato l'infragruppo CAM unendo i superregni Pancryptista e Archaeplastida.[2]


CAM
Pancryptista
 

Microhelida 

 
 

Cryptista 

 
 
Archaeplastida/Plantae
Rhodopicozoa
 

Alghe rosse (Rhodophyta)

 
 

Picozoa 

 
 
EuPlantae
 

Glaucophyta

 
 

Piante verdi (Viridiplantae)

 
 
 (+ Gloeomargarita lithophora)
 

Interna

Sulla base di un'analisi GlobE di massima verosimiglianza di 319 geni con un totale di 88.592 residui di amminoacidi, Yazaki et al. nel 2022 hanno mostrato la seguente disposizione:[2]


Pancryptista
 

Microheliella maris

 
Cryptista
 

Palpitia

 
 

Endohelea

 
 

Rollomonadia

 
 
 

Genomica

Genoma nucleare

Curtis et al. hanno sequenziato il genoma nucleare di Guillardia theta.[11] Non è noto se Palpitomonas bilix possieda l'olocitocromo c sintasi, né se le Katablepharidaceae o Goniomonada possiedano le maturasi del citocromo c .

Genoma mitocondriale

Palpitomonas bilix possiede un'antica citocromo c maturasi, ma la struttura del suo genoma è un carattere derivato. Sono stati sequenziati pochi mitogenomi di Pancryptista: oltre a due specie di Cryptophyta, è stato sequenziato il genoma di P. bilix . Quest'ultimo è un genoma lineare di circa 76 kbp di lunghezza, di cui circa 16 kbp sono in una "regione a ripetizione singola" e 60 kbp sono in due regioni identiche di 30 kbp in direzioni opposte. Questo genoma contiene i geni della citocromo c maturasi ccmA – ccmC e ccmF.[11]

Note

  1. ^ (EN) Matthew W. Brown, Susan C. Sharpe, Jeffrey D. Silberman, Aaron A. Heiss, B. Franz Lang, Alastair G. B. Simpson e Andrew J. Roger, Phylogenomics demonstrates that breviate flagellates are related to opisthokonts and apusomonads, in Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences, vol. 280, n. 1769, 22 ottobre 2013, p. 20131755, DOI:10.1098/rspb.2013.1755, ISSN 0962-8452 (WC · ACNP), PMC 3768317, PMID 23986111.
  2. ^ a b c d e Yazaki E, Yabuki A, Imaizumi A, Kume K, Hashimoto T, Inagaki Y, The closest lineage of Archaeplastida is revealed by phylogenomics analyses that include Microheliella maris, in Open Biol, vol. 12, n. 4, 13 aprile 2022, p. 210376, DOI:10.1098/rsob.210376, PMC 9006020, PMID 35414259.
  3. ^ a b c d e f g h Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, Del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJ, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EA, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q, Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes, in The Journal of Eukaryotic Microbiology, vol. 66, n. 1, January 2019, DOI:10.1111/jeu.12691.
  4. ^ a b c d Thomas Cavalier-Smith, Ciliary transition zone evolution and the root of the eukaryote tree: implications for opisthokont origin and classification of kingdoms Protozoa, Plantae, and Fungi, in Protoplasma, vol. 259, 2022, pp. 487–593, DOI:10.1007/s00709-021-01665-7.
  5. ^ a b Yabuki A, Inagaki Y, Ishida K, Palpitomonas bilix gen. et sp. nov.: A novel deep-branching heterotroph possibly related to Archaeplastida or Hacrobia, in Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 161, n. 4, October 2010, DOI:10.1016/j.protis.2010.03.001.
  6. ^ a b A. Yabuki, Microheliella maris (Microhelida ord. n.), an ultrastructurally highly distinctive new axopodial protist species and genus, and the unity of phylum Heliozoa, in Protist, vol. 163, n. 3, 2012, pp. 356–388, DOI:10.1016/j.protis.2011.10.001.
  7. ^ T. Cavalier-Smith, Multigene phylogeny and cell evolution of chromist infrakingdom Rhizaria: contrasting cell organisation of sister phyla Cercozoa and Retaria, in Protoplasma, vol. 255, n. 5, 17 aprile 2018, DOI:10.1007/s00709-018-1241-1.
  8. ^ (EN) Pancryptista, in WoRMS (World Register of Marine Species).
  9. ^ Burki F, Roger AJ, Brown MW, Simpson AGB, The New Tree of Eukaryotes, in Trends Ecol Evol, 9 ottobre 2019, DOI:10.1016/j.tree.2019.08.008. URL consultato il 15 luglio 2024. Template:Open access
  10. ^ Yazaki E, Imaizumi A, Kume K, Shiratori T, Hashimoto T, Yabuki A, Ishida K-I, Yuji I, Phylogenomic Analysis Assessing the Positions of “Orphans” Including Microheliella maris (PDF), VIII European Congress of Protistology – ISOP joint meeting. URL consultato il 23 luglio 2024.
  11. ^ a b Nishimura Y, Tanifuji G, Kamikawa R, Yabuki A, Hashimoto T, Inagaki Y, Mitochondrial Genome of Palpitomonas bilix: Derived Genome Structure and Ancestral System for Cytochrome c Maturation, in Genome Biol Evol, vol. 8, n. 10, 13 ottobre 2016, DOI:10.1093/gbe/evw217.

Voci correlate

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