Dopo avere lavorato come impiegato nella cittadina di Trois-Rivières si trasferì per motivi familiari ed economici a Montréal per lavorare come apprendista scultore presso Napoléon Bourassa.
Napoléon Bourassa inviò Louis Bourgeois a Parigi per studiare e perfezionarsi, ma Bourgeois preferì lasciare gli studi e viaggiare visitando altri paesi come l'Italia, la Grecia, l'Egitto e l'Iran.
Bourgeois rientrò negli Usa nel 1886 a Chicago, dove lavorò con l'architetto americano Louis Henri Sullivan noto come padre del modernismo.
Successivamente si trasferì in California dove conobbe il pittore Paul de Longpré, di cui sposò la figlia Alice.
Nel decennio successivo Bourgeois dedicò la maggior parte del suo tempo alla costruzione del tempio e al suo finanziamento, nonostante la sua salute peggiorasse.
Louis Bourgeois morì il 20 agosto 1930 all'età di 74 anni. Il tempio di Wilmette da lui disegnato fu inaugurato nel 1953.