La J1 League 2016, nota come Meiji Yasuda J1 League 2016 per ragioni di sponsorizzazione, è stata la ventiquattresima edizione del massimo livello del campionato giapponese di calcio. Il campionato è iniziato il 27 febbraio 2016 e si è conclusa il 3 dicembre 2016 con la finale per il titolo. Il Sanfrecce Hiroshima era la squadra campione in carica, avendo vinto la finale per il titolo della J1 League 2015. Il campionato è stato vinto dal Kashima Antlers, che nella doppia finale per il titolo ha sconfitto l'Urawa Red Diamonds.
A partire dalla stagione 2015 la formula del campionato è stata modificata, recuperando la formula del campionato in due fasi usata fino alla stagione 2004[1]. Il campionato si articola in due fasi ("stage"), durante le quali le 18 squadre si affrontano una volta sola per un totale di 17 partite per fase.
La prima classificata in ciascuna fase si qualifica ai playoff per l'assegnazione del titolo. Al termine delle due fasi le due classifiche vengono accorpate in un'unica classifica comprensiva delle 34 partite giocate. La prima classificata si qualifica direttamente alla finale per l'assegnazione del titolo. Le ultime 3 classificate retrocedono in J2 League.
Ai playoff per l'assegnazione del titolo partecipano da 3 a 5 squadre. La prima classificata nella classifica comprensiva delle 34 giornate (che accede direttamente alla finale), le due vincitrici delle due fasi e ogni altra squadra che sia tra le prime tre della classifica accorpata delle due fasi. In caso di cinque squadre, nel primo turno in partita unica la squadra vincente la singola fase con il punteggio più alto affronta la terza della classifica stagionale, mentre la squadra vincente la singola fase con il punteggio più basso affronta la seconda della classifica stagionale. Le due squadre vincenti si affrontano in partita unica per decidere chi affronterà la prima della classifica stagionale. In caso di tre squadre, la seconda e la terza della classifica complessiva delle due fasi si affrontano in partita unica per sfidare in finale la prima. La squadra vincitrice della finale è campione della J1 League 2016 e si qualifica per la Coppa del mondo per club FIFA 2016, essendo il Giappone paese ospitante. Le prime due classificate nella classifica comprensiva delle 34 giornate accedono alla fase a gironi della AFC Champions League 2017. La terza classificata nella classifica comprensiva delle 34 giornate accede all'ultimo turno di qualificazione della AFC Champions League 2017.