Numerosi sono gli endemismi anche nell'ambito dell'avifauna che comprende la colomba di Bolle (Columba bollii), la colomba dei lauri (Columba junoniae), il fringuello azzurro di Tenerife (Fringilla teydea), il fringuello azzurro di Gran Canaria (Fringilla polatzeki), il luì piccolo delle Canarie (Phylloscopus canariensis). Altre specie come la pispola di Berthelot (Anthus berthelotii), il rondone unicolore (Apus unicolor) e il canarino (Serinus canaria) sono condivise anche con altre isole della Macaronesia. Numerose poi sono le sottospecie endemiche come Falco tinnunculus canariensis, Regulus regulus teneriffae, Motacilla cinerea canariensis e Asio otus canariensis; in alcuni casi esistono addirittura sottospecie endemiche di singole isole; ci sono p.es. due differenti sottospecie di picchio rosso maggiore, Dendrocopos major canariensis, endemica di Tenerife, e Dendrocopos major thanneri, endemica di Gran Canaria, e quattro sottospecie di cinciarella delle Canarie, Cyanistes teneriffae teneriffae, diffusa a Tenerife e La Gomera, Cyanistes teneriffae ombriosus, endemica di El Hierro, Cyanistes teneriffae palmensis, ristretta a La Palma, e Cyanistes teneriffae hedwigae, endemica di Gran Canaria. Ancora più complesso lo stato tassonomico delle differenti sottospecie di fringuello: il Congresso Ornitologico Internazionale riconosce tre sottospecie, Fringilla coelebs canariensis, diffusa a Gran Canaria e Tenerife, Fringilla coelebs ombriosa, endemica di El Hierro, Fringilla coelebs palmae, endemica di La Palma. Secondo alcuni autori, le tre sottospecie andrebbero considerate come un'unica entità elevata al rango di specie a sé stante (Fringilla canariensis), all'interno della quale andrebbero distinte due sottospecie (Fringilla canariensis canariensis e Fringilla canariensis tintillon)[5][6]. Analoga situazione si osserva anche tra gli Scincidi ove si hanno Chalcides sexlineatus, diffuso a Gran Canaria, Chalcides coeruleopunctatus a La Gomera e El Hierro, Chalcides viridanus a Tenerife, La Gomera e El Hierro.
Anche la popolazione dei rettili fornisce interessanti esempi di radiazione adattativa. Tipico il caso delle lucertole giganti del genere Gallotia presenti con specie diverse in ogni isola, o addirittura con più di una specie per differenti nicchie ecologiche della stessa isola: abbiamo infatti la lucertola gigante di Gran Canaria (Gallotia stehlini), la lucertola gigante di El Hierro (Gallotia simonyi), la lucertola gigante di La Gomera (Gallotia bravoana), la lucertola gigante di La Palma (Gallotia auaritae), la lucertola maculata delle Canarie (Gallotia intermedia), endemica di Tenerife, la piccola lucertola delle Canarie (Galliota caesaris), endemica di La Gomera e El Hierro e la lucertola delle Canarie occidentali (Gallotia galloti) diffusa sulle isole di Tenerife e La Palma.[7] Analoga situazione si osserva anche tra gli Scincidi dove si hanno Chalcides sexlineatus, diffuso a Gran Canaria, Chalcides coeruleopunctatus a La Gomera e El Hierro, Chalcides viridanus a Tenerife, La Gomera e El Hierro.