Florent-Emilio Siri ha studiato cinema alla Sorbona e alla ESRA a Parigi. Ha iniziato la sua carriera cinematografica nel 1998 con il film sociale Une minute de silence (Un minuto di silenzio), proseguendo nel 2002 con il film d'azione Nido di vespe. Successivamente si dedicò alla regia di due videogiochi prodotti dalla Ubisoft: Splinter Cell: Pandora Tomorrow e Splinter Cell: Chaos Theory.
Fu Bruce Willis a volere Siri per dirigere il suo film del 2005, Hostage, che pur non essendo un grande successo commerciale, donò molta visibilità al regista che riscosse buone critiche.
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Nel 2007 ha realizzato una pellicola intitolata L'Ennemi intime (Intimate Enemies) trattando gli aspetti personali e gli effetti psicologici sugli individui coinvolti nella guerra di Algeria..