Nata a Olst, nei Paesi Bassi centrali, nel 1996, ha iniziato a giocare a calcio nella sua città, con l'Overwetering, rimanendovi fino ai 14 anni, quando è passata nelle giovanili del Twente. Dopo 3 anni, all'inizio della stagione 2013-2014 ha fatto il suo esordio in prima squadra, il 10 agosto 2013, entrando al 70' del successo per 4-0 sulle croate dell'Osijek in Women's Champions League, nel turno preliminare giocato proprio nei Paesi Bassi[1]. Ha segnato la sua prima rete con la squadra di Enschede il 16 maggio 2014, realizzando al 61' il momentaneo 2-0 nella vittoria interna per 2-1 sull'Heerenveen della 27ª giornata di BeNe League, campionato che univa squadre olandesi e belghe[2]. Con le biancorosse ha giocato 4 stagioni, ottenendo più di 100 presenze e 5 gol e vincendo la BeNe League2014, la Coppa d'Olanda2015 e l'Eredivisie2016.
Il 1º giugno 2019 Danique decide di trasferirsi, sottoscrivendo un accordo con il Brighton & Hove per la stagione entrante.[6] Ha giocato con la squadra biancoblu per tre stagioni consecutive in FA Women's Super League, accumulando 53 presenze e una sola rete. Per la stagione 2022-23 ha lasciato l'Inghilterra per tornare nei Paesi Bassi, tornando al Twente dopo cinque anni.[7]
Nazionale
Ha esordito nelle nazionali giovanili dei Paesi Bassi nell'aprile 2014, poco prima di compiere 18 anni, con l'Under-19, partecipando a 3 gare delle qualificazioni all'Europeo di categoria di Norvegia 2014. Convocata anche per la fase finale del torneo, Kerkdijk è scesa in campo in tutte e 5 le gare delle Oranje, compresa la finale vinta per 1-0 contro la Spagna il 27 luglio, conquistando così l'Europeo giovanile, il primo di sempre per le olandesi. Schierata anche in 6 gare delle qualificazioni al torneo successivo di Israele 2015, non è però riuscita ad ottenere la qualificazione alla fase finale.