CPTM gestisce 57 stazioni su cinque linee per una lunghezza totale di 199 chilometri. Trasporta circa 2 milioni di passeggeri al giorno. Il 7 dicembre 2018, CPTM ha stabilito un record di passeggeri nei giorni feriali con 3.221.035 corse.
Tra la fine degli anni '90 e l'inizio degli anni 2000, CPTM ha avviato la riconversione di alcune tratte urbane per fornire un servizio simile a quello metropolitano e meglio integrarsi con la metropolitana di San Paolo. La maggior parte delle stazioni in cui sono stati ricostruiti o modernizzati e sono stati acquistati nuovi treni, consentendo l'avanzamento delle linee fino a quattro minuti in alcune linee. Questa esperienza è iniziata sulla Linea E nel 2000, nel tratto noto come "East Express", che serve l'estremità est di San Paolo e corre parallela alla Linea 3 - Rossa.
Il proposto progetto ferroviario regionale Trens Intercidades sta prendendo in considerazione l'utilizzo dei binari della linea 7 per fornire il servizio alle città vicine di Jundiaí, Campinas e Americana[1][2].
Nel 2018, CPTM ha aperto al traffico la Linea 13, la prima linea completamente costruita e gestita dall'azienda. Questa tratta collega la linea 12 all'aeroporto internazionale di San Paolo-Guarulhos con uno speciale servizio espresso che la unisce alla stazione centrale di Luz, mentre un altro servizio la collega alla stazione di Brás. Entrambi operano solo su orari specifici[3].
Servizi
CPTM gestisce cinque linee, ciascuna identificata da un numero e da un colore. La maggior parte di queste linee corre su binari di superficie esistenti che proseguono fuori dalla Grande San Paolo come linee merci interurbane MRS Logística e condividono il diritto di precedenza rispetto ai treni merci. I tratti esterni meno utilizzati di diverse linee hanno passaggi a livello.
Il servizio passeggeri inizia tutti i giorni alle 4 del mattino e termina a mezzanotte. Il sabato il trasporto è prolungato fino all'una di notte.
L'azienda addebita una tariffa fissa che può essere pagata con il biglietto magnetico venduto nelle stazioni o con una smartcard ricaricabile e garantisce l'accesso a tutte le linee ferroviarie della Grande San Paolo, comprese le linee gestite dalla metropolitana di San Paolo.