La cronometro maschile Under-23 dei Campionati del mondo di ciclismo su strada 2003 è stata corsa il 7 ottobre in Canada, nei dintorni di Hamilton, su un percorso di 30,3 km. L'oro andò al tedesco Markus Fothen che vinse con il tempo di 38'35"29 alla media di 47,11 km/h, argento all'olandese Niels Scheuneman e a completare il podio il russo Alexandr Bespalov.
