Komune ini dinamai karena letak geografisnya di persimpangan sungai Seine dan Oise. Desa tersebut diberi tambahan nama "Saint Honorine" pada abad ke-13 setelah wanita bernama Saint Honorina, yang tulang belulangnya disimpan di sana sejak 876.
Karena posisinya yang strategis, Conflans-Sainte-Honorine dianggap sebagai ibu kota jalur air darat Prancis, dan tepi kanan Sungai Seine masih dipenuhi kapal barang (meskipun saat ini digunakan sebagai kapal rumah). Setiap tahun bulan Juni, kota ini merayakan "Pardon national de la batellerie" untuk memperingati sejarahnya pada perkapalan darat.
