1 A felnőtt klubokban játszott mérkőzések és gólok csak a bajnoki mérkőzések adatait tartalmazzák. Utolsó elszámolt mérkőzés dátuma: 2023. július 12. 2 Utolsó elszámolt válogatott mérkőzés dátuma: 2017. október 12.
Pályafutása elején a Teplice játékosa volt. A klub utánpótláscsapataiban nevelkedett és ott mutatkozott be a felnőttek között, a cseh élvonalban a 2012. október 31-én a Hradec Králové elleni mérkőzésen.[2] Tizenhárom bajnokin kapott lehetőséget első idényében, első gólját pedig az akkori címvédő Slovan Liberec ellen szerezte 2012 novemberében. 2016 decemberében szerződtette a Slavia Praha, Lüftner bevallottan kedvenc csapata, amely miatt akkor sajtóhírek szerint olasz érdeklődést is visszautasított.[3] 2020 nyaráig írt alá a prágai csapathoz, amely szintén akkori sajtóétesülések szerint félmillió eurót fizetett érte,[4] és amellyel a 2016–17-es szezonban bajnoki címet nyert.
2017 májusában a dán első osztályban szereplő København az 1,5 millió eurós kivásárlási árát kifizetve igazolta le a cseh középhátvádet.[4][5] A koppenhágai együttesben egy MŠK Žilina elleni Bajnokok Ligája-selejtezőn mutatkozott be 2017. július 12-én. Alapembere volt a szezon végén bajnoki címet szerző csapatnak, azonban az azt követő idényben mindössze egy bajnokin lépett pályára, egy súlyos sérülés miatt a szezon hátralevő részét ki kellett hagynia. 2019. június 20-án hivatalossá vált, hogy a következő szezont kölcsönben a ciprusi Omóniánál tölti. Kölcsönszerződését később újabb egy szezonra meghosszabbították.[6][7] Az Omóniával bajnoki címet nyert a 2020–2021-es idényben, és szerepelt az Európa-liga csoportkörében is. 2021 nyarán a MOL Fehérvár szerződtette.[8] 2022. augusztus 31-én bejelentették, hogy a felek közös megegyezéssel szerződést bontanak.[9][10] 2023. május 21-én bejelentették, hogy az FK Teplice tartalékcsapatában folytatja pályafutását.[1]
