Budapesten született Kaufman Rezső (1876–1943)[5] divatáru-kereskedő és Messer Sarolta (1878–1959)[6] gyermekeként. 1927-ig a pécsi Erzsébet Tudományegyetem Orvostudományi Karának hallgatója volt, majd a budapesti Pázmány Péter Tudományegyetemen tanult műteni, miközben dr. Ádám Lajossal dolgozott. Mind a sebészetben, mind a radiológiában bizonyított.[7]
1963 novembere és 1964 februárja között Zsivótzky Gyula olimpiai bajnok életét három lépcsős, igen nehéz műtét sorozattal tudta megmenteni doktor Mester Endre professzor az I. Sebészeti Klinikán.[11]
1967-ben Balassa-díjat kapott az "újabb törekvések az epeutak sebészetében" című előadása folytán.[12]1971-ben megkapta az MTA doktora címet a Magyar Tudományos Akadémiától.
1972. szeptember 27-én elnyerte az orvostudomány doktora fokozatot.
1965-ben elkezdte a lézerkutatását. 1974-ben alapította meg a Semmelweis Lézeres Kutatóközpontot, és az élete hátralevő részéig folytatta munkáját. Az ő nevéhez kötődik a lágylézer felfedezése.[14][15]
Kiadványai az alacsony intenzitású lézer biostimuláló hatásairól 1967-ben kezdődtek.Tudományos kísérleteket végzett a lézersugárzás biológiai hatásairól. 1967-ben publikálta megfigyelését,
hogy kis teljesítményű lézer hatására a borotvált hátú egereken a szőr gyorsabban nőtt ki, mint a nem kezelt társaikén.[16]
1971-től az alacsony intenzitású lézerrel páciensei nehezen gyógyuló lábszárfekélyeit kezelte eredményesen.
Több mint 100 cikket publikált a kutatási területein. A két fia, Mester Ádám orvos doktor, radiológus és Mester András orvos doktor, fül-orr-gégész a későbbiekben segítették őt a munkájában.
